劉小澤寫(xiě)于19.1.20-21要進(jìn)行GO或者KEGG富集分析，就需要知道每個(gè)基因?qū)?yīng)什么樣的GO/KEGG分類，OrgDb就是存儲(chǔ)不同數(shù)據(jù)庫(kù)基因...
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測(cè)序了，然后呢（四）有了OrgDb才能進(jìn)行富集分析 -
topGO:大概是致力于GO分析方法論的R包Gene set enrichment analysis with topGO Alexa A, Rahnenfuhrer J (2019). ...
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clusterProfiler: 分析+可視化GO和KEGG富集的轉(zhuǎn)錄組R包寫(xiě)作之友 基因和基因簇的功能譜 (functional profiles) 的統(tǒng)計(jì)學(xué)分析及可視化 G Yu, LG Wang, Y Han, Q...
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RNA的剪切過(guò)程
外顯子（exon expressed region）是真核生物基因的一部分，它在剪接(Splicing)后仍會(huì)被保存下來(lái)，并可在蛋白質(zhì)生物合成過(guò)...
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RNA-seq數(shù)據(jù)分析---方法學(xué)文章的實(shí)戰(zhàn)練習(xí)前言 這次給大家?guī)?lái)的是16年發(fā)表在NATURE PROTOCOLS上面的一篇處理RNA-seq數(shù)據(jù)的文章：Transcript-level e...
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WGCNA分析，簡(jiǎn)單全面的最新教程本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會(huì)出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號(hào)組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析實(shí)戰(zhàn)班上，...
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Gfold說(shuō)明書(shū)（備份）
本文資料來(lái)源 https://web.archive.org/web/20161125133249/http://compbio.#...
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無(wú)重復(fù)RNAseq樣本Gfold值的計(jì)算
使用Gfold進(jìn)行無(wú)重復(fù)RNAseq數(shù)據(jù)基因差異分析 1. 準(zhǔn)備資料 輸入的資料為read_count，要對(duì)兩個(gè)樣本進(jìn)行差異分析則必需準(zhǔn)備兩個(gè)文...
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