1. 基因DNA分為編碼區(qū)和非編碼區(qū)，編碼區(qū)包含外顯子和內(nèi)含子，一般非編碼區(qū)具有基因表達(dá)的調(diào)控功能，如啟動(dòng)子在非編碼區(qū)。編碼區(qū)則轉(zhuǎn)錄為mRNA并...
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真核生物基因結(jié)構(gòu)圖（外顯子、內(nèi)含子、mRNA、CDS區(qū)別） -
RNA-seq摸索：4. edgeR/limma/DESeq2差異基因分析→ggplot2作火山圖→biomaRt轉(zhuǎn)換ID并注釋請(qǐng)一定看這里：寫(xiě)下來(lái)只是為了記錄一些自己的實(shí)踐，當(dāng)然如果能對(duì)你有所幫助那就更好了，歡迎大家和我交流 差異分析流程: 1 初始數(shù)據(jù) 2 標(biāo)準(zhǔn)化(n...
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【群體遺傳】Fst（群體間分化指數(shù)）（1）是什么？含義是什么？ ，全稱(chēng)為fixation index，是一種用于衡量群體間分化程度的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)量（由Wright's F-statis...
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R語(yǔ)言里可視化多序列比對(duì)（paf格式）的R包：pafrpafr包的參考鏈接 https://cran.r-project.org/web/packages/pafr/vignettes/Introd...
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一條命令行區(qū)分Contigs中的真核原核序列
本文介紹一款可用于宏基因組中的分類(lèi)小軟件，簡(jiǎn)單一條命令可以將上游組裝的Contigs進(jìn)行原核與真核生物區(qū)分~ Github地址：https://...
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GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中下載的平臺(tái)文件沒(méi)有基因名或者基因名不全怎么辦
在GEO數(shù)據(jù)庫(kù)中我們經(jīng)常會(huì)遇到下載的GPL平臺(tái)文件沒(méi)有基因名，或者我們所需要的基因在里面找不到 ①可能是由于數(shù)據(jù)集作者使用的芯片擁有版權(quán)未開(kāi)放下...
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四種獲取fasta序列長(zhǎng)度的方法轉(zhuǎn)自：http://www.itdecent.cn/p/d27d5ab8d6f0[http://www.itdecent.cn/p/d27d...
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使用fasterq-dump命令將sra格式數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為fastq格式遇到的問(wèn)題
從NCBI下載了一些轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，這里用到的下載工具是kingfisher ,github的鏈接是 https://github.com/wwoo...
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曹洋課題組 | Labshare 生物信息學(xué)在線(xiàn)軟件集錦記錄一個(gè)主頁(yè)曹洋課題組 | Labshare 生物信息學(xué)在線(xiàn)軟件集錦地址：http://www.labshare.cn/biosoft/inde...
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基因家族：pfam數(shù)據(jù)庫(kù)下載基因家族的HMM模型一、序 目前對(duì)蛋白基因家族進(jìn)行分析主要有兩種方法，一基于同源性，二基于HMM模型。想要通過(guò)HMM模型預(yù)測(cè)蛋白基因家族，首先得需要HMM模型數(shù)據(jù)。...
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