Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencin...
投稿
Automatic cell type identification methods for single-cell RNA sequencin...
Basic usage 這里,我們使用cellassign包自帶的示例數(shù)據(jù)簡(jiǎn)單演示其基本用法。首先,加載相關(guān)的R包和示例數(shù)據(jù): 接下來(lái),我們計(jì)算...
作者,追風(fēng)少年i 新的一周,新的開(kāi)始,接上一篇,10X空間轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析之細(xì)胞的空間依賴性[http://www.itdecent.cn/p/...
時(shí)代的洪流奔涌而至,單細(xì)胞技術(shù)也從舊時(shí)王謝堂前燕,飛入尋常百姓家。雪崩的時(shí)候,沒(méi)有一片雪花是無(wú)辜的,你我也從素不相識(shí),到被一起卷入單細(xì)胞天地。R...
1. 建立genome的索引 Note: /gpfs02/home/jingjing/software/cellranger-4.0.0/lib...
題記: Cell barcode的加入就是了識(shí)別不同的細(xì)胞,為什么分析中還要加入real cell barcode的識(shí)別過(guò)程,我自己check了...
題記:因?yàn)槲覀冊(cè)跍?zhǔn)備煙草某些部位單細(xì)胞樣品的時(shí)候,質(zhì)量和活性總是比較低,所以對(duì)于比較難制備的樣品,有的人推薦我們嘗試一下snRNA-seq。就去...
教程背景 這個(gè)例子演示了允許用戶使用Seurat分析和探索多模式數(shù)據(jù)的新特性。雖然這只是一個(gè)初始版本,但我們很高興在未來(lái)為多模態(tài)數(shù)據(jù)集發(fā)布重要的...