MEGAN（Metagenome Analyzer）是宏基因組學(xué)進(jìn)行物種和功能研究的常用軟件，實(shí)際上現(xiàn)在的Diamond+MEGAN6已經(jīng)是一套...
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【宏基因組】MEGAN4，MEGAN5和MEGAN6的Linux安裝和使用 -
宏基因組學(xué)是什么？16S 測序和宏基因組測序分析有哪些？宏基因組學(xué) 宏基因組學(xué)[https://baike.baidu.com/item/%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E7%BB%84%E5%...
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宏基因組之物種注釋（基于nr庫）昨天下午搗鼓了一下宏基因組物種注釋過程(基于nr庫)，現(xiàn)在將整個流程記錄一下。軟件需求：blast，diamond，taxonkit(安裝自行百...
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HUMAnN2 宏基因組分析 | 小白版導(dǎo)讀 使用 HUMAnN2（The HMP Unified Metabolic Analysis Network 2）進(jìn)行宏基因組學(xué)分析。 HU...
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宏基因組功能注釋（以COG為例）Contigs/Scaffolds序列經(jīng)基因預(yù)測、ORF開放閱讀框識別（Open Reading fr ame）和蛋白翻譯之后，就可以進(jìn)行功能注...
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Kraken2+Bracken
1. 簡介 Kraken2是一個基于k-mer算法的高精度宏基因組序列分類軟件，能夠快速的將測序reads進(jìn)行物種分類。 Kraken2官網(wǎng)[h...
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宏基因組 + 宏轉(zhuǎn)錄組分析工具：HUMAnN導(dǎo)讀 HUMAnN（全稱HMP Unified Metabolic Analysis Network）最早由Curtis Huttenhower...
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MetaPhlAn2宏基因組物種注釋導(dǎo)讀 上一篇介紹了MetaPhlAn：宏基因組微生物分類分析教程[http://www.itdecent.cn/p/015cbdb80ce1]...
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MetaPhlAn1宏基因組物種注釋導(dǎo)讀 1 MetaPhlAn獲得宏基因組物種和物種豐度2 MetaPhlAn結(jié)果合并和可視化3 GraPhlAn繪制進(jìn)化樹4 LEfSe尋找分類...
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Docker封裝生物信息學(xué)宏基因組流程宏基因組學(xué)（metagenomics）是一種以環(huán)境樣品中的微生物群體所有基因組作為研究對象，利用基因組學(xué)的研究策略研究環(huán)境樣品中所包含的全部微生...
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