LDSC 除了可以計(jì)算基因多效性、遺傳度、遺傳相關(guān)性[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg2MDA2MDQz...
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Post-GWAS：LDSC 的 Partitioned Heritability 分析
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復(fù)現(xiàn)一篇高分(IF = 11.274)孟德爾隨機(jī)化分析文章-day1
Title: Association between Human Blood Metabolome and the Risk of Alzhei...
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復(fù)現(xiàn)一篇高分(IF = 11.274)孟德爾隨機(jī)化分析文章-day3話不多說，直接上代碼 部分結(jié)果展示 step 5. 所有SNP的F-stat值都大于10，因此都納入分析中 step 6. 異質(zhì)性檢測(cè)結(jié)果 p ...
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盤點(diǎn)2022年孟德爾隨機(jī)化高分文章
都2022年了，竟然還有孟德爾隨機(jī)化能發(fā)IF > 10的文章！??！敲黑板，重點(diǎn)：所用數(shù)據(jù)全都是公共數(shù)據(jù)，完全可以復(fù)現(xiàn)?。?！孟德爾隨機(jī)化YYDS歡...
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群體進(jìn)化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全基因流（也稱基因遷移）是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)，從而改變?nèi)后w“基因庫(kù)”的組成。通過基因交流向群體中引入新的等位基因，...
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TwoSampleMR：兩樣本孟德爾隨機(jī)化孟德爾隨機(jī)化推斷暴露因素與健康結(jié)局的因果關(guān)系[http://www.itdecent.cn/p/8ac31267d3d8] 主要步驟：1. 讀...
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數(shù)量性狀遺傳性狀分類 質(zhì)量性狀（qualitative trait）表型之間截然不同，具有質(zhì)的差別，用文字描述的性狀，在群體中呈間斷分布。如豌豆花色，籽粒是...
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單體型分析單倍型分析理論上來(lái)說，單倍型的類別是2N，但由于LD的存在，會(huì)使得單倍型的類別遠(yuǎn)遠(yuǎn)的小于2N，但是如果當(dāng)N的數(shù)目很大，即便是類別少，在整個(gè)群體中...
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GWAS位點(diǎn)簡(jiǎn)單進(jìn)行峰拆分輸出QTNs并基于GFF關(guān)聯(lián)基因
來(lái)自rMVP的關(guān)聯(lián)后的數(shù)據(jù)；峰拆分輸出QTNsgetposQTNs.py 基于GFF關(guān)聯(lián)基因，以水稻RAP注釋為例（locus.gff文件；ht...
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iTOL美化系統(tǒng)發(fā)育樹前言：我在美化進(jìn)化樹的時(shí)候，某站上搜了很多視頻，但是都是寥寥幾句帶過，沒有太大的實(shí)用價(jià)值，于是我下定決心要在iTOL官網(wǎng)學(xué)習(xí)，便摸索出了對(duì)于我自...
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