clusterProfiler是業(yè)界大神Y叔寫的R包，看過了它的繪圖就會使人沉迷于其顏值無法自拔。本文很多內容直接翻譯自官方文檔，加上了我的測試...
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使用clusterProfiler進行富集分析 -
轉錄組分析——STAR+RSEM+Deseq2STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?...
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基因表達分析（中）- 富集分析
回顧 首先對基因表達分析（上）做一個簡單的回顧 研究基因表達的有如下工具：RNA-Seq，microarray， qRT-PCR等（歡迎補充） ...
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RNA sequencing: the teenage years（下篇）
前言 這一部分的內容主要涉及單細胞測序，空間轉錄組，新生RNA測序，翻譯組，RNA-RNA之間相互作用，RNA-蛋白質相互作用以及未來展望。 常...
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RNA sequencing: the teenage years（中篇）
前言 這一部分主要涉及常規(guī)RNA-seq的數(shù)據(jù)分析，提到了常見的數(shù)據(jù)分析流程。 RNA-seq數(shù)據(jù)分析 用于分析測序讀長以確定差異表達的計算方法...
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RNA sequencing: the teenage years（上篇）
《RNA sequencing: the teenage years》這篇綜述翻譯了一下，全篇漢字大約是3萬字，比較長，為了方便閱讀，把它拆成3...
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轉錄組拼接很難？一文讀懂轉錄組拼接，實戰(zhàn)教學lz從今天開始希望跟大家分享一些生信的實戰(zhàn)，希望與大家一起進步，前段時間應老板的要求自學的轉錄組的拼接原理，經(jīng)過一番折騰，最終在超算平臺的幫...
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為什么說FPKM和RPKM都錯了？
這本是三年多之前我發(fā)在公眾號上的一篇舊文，一些偶然的機會，發(fā)現(xiàn)不少朋友也在討論這個問題，因此我重新做了梳理并發(fā)出來。這樣的討論是有益的，放在今天...
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「文獻」多倍體植物基因組測序組裝當前策略
「文獻」多倍體植物基因組測序組裝當前策略 文獻地址: Current Strategies of Polyploid Plant Genome ...
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clusterProfiler: 分析+可視化GO和KEGG富集的轉錄組R包寫作之友 基因和基因簇的功能譜 (functional profiles) 的統(tǒng)計學分析及可視化 G Yu, LG Wang, Y Han, Q...
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