這是我聽孟浩巍知乎Live：生信進(jìn)階第1課-重復(fù)Nature文章和B站視頻：高通量測序技術(shù)交流錄像里的筆記哦~ 目錄：文章的主要結(jié)論解讀傳統(tǒng)RN...
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解析單細(xì)胞RNA-Seq Nature文章 -
igraph包可視化基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)參考教程：https://www.biostars.org/p/285296/[https://www.biostars.org/p/28529...
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批量轉(zhuǎn)換基因名
做通路富集分析常需要批量進(jìn)行基因ID轉(zhuǎn)換，總結(jié)了3種簡便方法與大家分享。方法1和2依賴于基因組注釋R包，如果無相應(yīng)物種R包就必須用方法3。好在的...
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RPKM，F(xiàn)PKM和TPM明確解釋| RNA-Seq博客
RPKM，F(xiàn)PKM和TPM明確解釋| RNA-Seq博客 來自StatQuest 過去，當(dāng)您進(jìn)行RNA測序時(shí)，您以RPKM（Reads Per ...
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差異分析
差異基因的篩選方法 統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)得到p值 比方說你想研究什么基因，可以在全部都是腫瘤組織里面以某個(gè)基因分類，分成高表達(dá)和低表達(dá)的兩組，兩組數(shù)據(jù)進(jìn)行不...
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20個(gè)轉(zhuǎn)錄組知識點(diǎn)-你必須知道！
隨著測序成本的不斷下降，轉(zhuǎn)錄組測序分析已然成為生物學(xué)及醫(yī)學(xué)研究不可或缺的技術(shù)手段。 但是，對于大多數(shù)初學(xué)者來說，會(huì)遇到各種各樣的問題。這里，小編...
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RNA-seq分析簡潔版前面RNA-seq分析：從軟件安裝到富集分析部分已經(jīng)把轉(zhuǎn)錄組全部流程走完了一遍，這次利用RNA-seq(2)-2:下載數(shù)據(jù)中下載的肝癌數(shù)據(jù)進(jìn)行分...
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【轉(zhuǎn)錄組01】轉(zhuǎn)錄組背景、環(huán)境設(shè)置（目錄管理）文獻(xiàn)學(xué)習(xí) 【要做筆記】1.A comprehensive evaluation of normalization methods for ill...
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什么是RIN值？樣本提取是實(shí)驗(yàn)關(guān)鍵一環(huán)，沒有好的樣本，一切數(shù)據(jù)就猶如沒有地基的大廈，蓋得越高，傾覆的概率就會(huì)越大！所以開展好一個(gè)實(shí)驗(yàn)，首先要從評價(jià)核酸質(zhì)量是否達(dá)...
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RPKM、FPKM、TPM詳解
簡寫 RPKM: Reads Per Kilobase of exon model per Million mapped reads (每千個(gè)堿...
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