論文 Drivers and trends of global soil microbial carbon over two decades h...
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跟著Nature Communications學(xué)數(shù)據(jù)分析：R語(yǔ)言做隨機(jī)森林模型并對(duì)變量重要性排序 -
R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)GWAS結(jié)果顯著SNP位點(diǎn)歸類提取與變異類型轉(zhuǎn)化
GWAS結(jié)果顯著SNP位點(diǎn)歸類提取與變異類型轉(zhuǎn)化 根據(jù)GWAS得到的Rresult文件信息，能夠找出每個(gè)snp位點(diǎn)對(duì)應(yīng)的顯著性情況和基因變異信息...
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TCGA表達(dá)矩陣行名一鍵轉(zhuǎn)換
直接說(shuō)答案，新版的tinyarray里面加了一個(gè)函數(shù)，trans_exp_new，pia的以下就轉(zhuǎn)換成功，不只是TCGA的，任何以ensembl...
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利用R語(yǔ)言實(shí)現(xiàn)vcf轉(zhuǎn)txt算法，基于vcfR和tidyverse
算法：vcf轉(zhuǎn)txt并自動(dòng)規(guī)范化 引言 vcf文件是存放基因變異信息的一種方式，本文提供一種算法，用于讀取vcf文件并轉(zhuǎn)換等位基因展示方法、替換...
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R，Python一塊學(xué)，2023年可以考慮更新一下Rstudio了
前段時(shí)間，Rstudio宣布了更新，同時(shí)也改名成了Posit，功能更新的不多，但這個(gè)趨勢(shì)確實(shí)給了我們一個(gè)提醒，同時(shí)對(duì)于有作圖需求的小伙伴，我覺得...
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R可視化——圖形繪制過(guò)程中如何實(shí)現(xiàn)局部放大？數(shù)據(jù)及基礎(chǔ)圖形的繪制 1、數(shù)據(jù)——以R自帶數(shù)據(jù)集iris為例 2、基于ggplot2包繪制散點(diǎn)圖 局部放大效果的實(shí)現(xiàn) 1、加載包——主要基于gg...
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不調(diào)包！自己整一個(gè)KNN函數(shù)（更新版）
KNN，全稱K-Nearest Neighbors Algorithm，是一種非參數(shù)、監(jiān)督的分類方法。 那么引出一個(gè)問(wèn)題：如何使用R語(yǔ)言編寫一個(gè)...
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「R語(yǔ)言刷題筆記」數(shù)據(jù)類型篇 - 從tidyr和dplyr入手
R語(yǔ)言到底可以用來(lái)做什么？ 在生物信息學(xué)領(lǐng)域，大數(shù)據(jù)、機(jī)器學(xué)習(xí)等方向，和Python一比，我感覺已經(jīng)相形見絀， 所以為什么還要學(xué)習(xí)R語(yǔ)言？ 1）...
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正則化，歸一化，標(biāo)準(zhǔn)化的區(qū)別與聯(lián)系首先，標(biāo)準(zhǔn)化的英文是Standardization，歸一化的英文是Normalization，正則化的英文是Regularization。標(biāo)準(zhǔn)化...
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【R語(yǔ)言】--- 回歸分析最優(yōu)擬合模型及作圖因變量和自變量間的擬合關(guān)系對(duì)于生態(tài)學(xué)而言極其重要，很多因變量和自變量間關(guān)系是一元線性回歸，然而很多數(shù)據(jù)并不一定是直線關(guān)系，而是需要探索其曲線擬合...
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