今天開(kāi)始差異分析的學(xué)習(xí)(開(kāi)心),r什么的最熟悉了~ 差異分析 1. 補(bǔ)充上節(jié)內(nèi)容 STAR + featureCounts = STAR + H...
表達(dá)定量 1. 處理原始比對(duì)文件 利用 picard / samtools 將 sam 格式轉(zhuǎn)換為 bam 格式 對(duì) bam 文件進(jìn)行排序 去除...
今天進(jìn)行序列比對(duì)課程的學(xué)習(xí) 序列比對(duì) 1. 無(wú)參轉(zhuǎn)錄組 1.1 使用拼接工具組裝轉(zhuǎn)錄本trinity 1.2 trinity 提供了一整套 RN...
學(xué)習(xí)——數(shù)據(jù)下載及質(zhì)控 數(shù)據(jù)預(yù)處理 1. 準(zhǔn)備工作 1.1 構(gòu)建項(xiàng)目目錄 “基因組文件”與“注釋信息文件”放在同一個(gè)目錄中 原始數(shù)據(jù)目錄 結(jié)果文...
線下課程回顧 1. 生物信息概述 1.1 生物信息所需技能1.2 入門生物信息的方法 2. 數(shù)據(jù)如何產(chǎn)生 2.1常見(jiàn)測(cè)序平臺(tái)和測(cè)序類型 測(cè)什么決...
今天進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)的第二課:生物信息軟件的安裝 Linux下conda的特性: 開(kāi)源 package管理系統(tǒng) 環(huán)境管理系統(tǒng) 跨平臺(tái)使用(win...