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轉(zhuǎn)錄組入門學(xué)習(xí)（六）今天開(kāi)始差異分析的學(xué)習(xí)（開(kāi)心），r什么的最熟悉了～ 差異分析 1. 補(bǔ)充上節(jié)內(nèi)容 STAR + featureCounts = STAR + H...
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轉(zhuǎn)錄組入門學(xué)習(xí)（五）表達(dá)定量 1. 處理原始比對(duì)文件 利用 picard / samtools 將 sam 格式轉(zhuǎn)換為 bam 格式 對(duì) bam 文件進(jìn)行排序 去除...
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轉(zhuǎn)錄組入門學(xué)習(xí)（四）今天進(jìn)行序列比對(duì)課程的學(xué)習(xí) 序列比對(duì) 1. 無(wú)參轉(zhuǎn)錄組 1.1 使用拼接工具組裝轉(zhuǎn)錄本trinity 1.2 trinity 提供了一整套 RN...
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轉(zhuǎn)錄組入門學(xué)習(xí)（三）
學(xué)習(xí)——數(shù)據(jù)下載及質(zhì)控 數(shù)據(jù)預(yù)處理 1. 準(zhǔn)備工作 1.1 構(gòu)建項(xiàng)目目錄 “基因組文件”與“注釋信息文件”放在同一個(gè)目錄中 原始數(shù)據(jù)目錄 結(jié)果文...
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轉(zhuǎn)錄組入門學(xué)習(xí)（二）
線下課程回顧 1. 生物信息概述 1.1 生物信息所需技能1.2 入門生物信息的方法 2. 數(shù)據(jù)如何產(chǎn)生 2.1常見(jiàn)測(cè)序平臺(tái)和測(cè)序類型 測(cè)什么決...
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轉(zhuǎn)錄組入門學(xué)習(xí)（一）
今天進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí)的第二課：生物信息軟件的安裝 Linux下conda的特性： 開(kāi)源 package管理系統(tǒng) 環(huán)境管理系統(tǒng) 跨平臺(tái)使用（win...
