如果你真的想做一件事情,那么就算障礙重重,你也會(huì)想盡一切辦法去辦到它。但若是你不是真心的想要去完成一件事情,那么縱使前方道路平坦,你也會(huì)想盡一切...
1.加載現(xiàn)有的物種database
DAVID搞定功能通路富集分析 說起DAVID,沒有涉及過高通的小伙伴們會(huì)以為這是一個(gè)人名,而對(duì)高通量稍有了解的人就會(huì)知道其實(shí)它是一款在線免費(fèi)分...
會(huì)不會(huì)編程,就看會(huì)不會(huì)使用字典 練習(xí)1:fas文件序列提?。?
在研究生的時(shí)候,就用R繪制過韋恩圖,正如之前所言的,我當(dāng)時(shí)基本上對(duì)組學(xué)一無所知,對(duì)R也是剛知道。但是當(dāng)時(shí)老板給了9例轉(zhuǎn)錄組的數(shù)據(jù),只好硬著頭皮去...
現(xiàn)有比對(duì)工具在做mapping之前,都需要下載對(duì)應(yīng)物種的參考基因組做index,而如何選擇合適的參考基因組是一件非常重要的事情。 現(xiàn)有的參考基因...
STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開, https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?...
參考:https://github.com/shenmengyuan/RNA_seq_Biotrainee 基礎(chǔ)知識(shí)部分 Fastqc 堿基質(zhì)量...
當(dāng)二代測序的原始數(shù)據(jù)拿到手之后,第一步要做的就是看一看原始reads的質(zhì)量。常用的工具就是fastqc (http://www.bioinfor...