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生信log48|如何在MacOS中安裝和運(yùn)行Singularity鏡像啊，因?yàn)榫W(wǎng)絡(luò)問題無法在服務(wù)器中直接用Singularity拉取鏡像了，因此在本地電腦中拉取。由于系統(tǒng)是MacOS, Singularity官方并...
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生信log47|Trim Galore的singularity鏡像用法和構(gòu)建思路-附我的AI鏡像構(gòu)建助手
最近重新深入生信分析的學(xué)習(xí)，重新看一下轉(zhuǎn)錄組還有其他分析方法看新工具和新思路。這篇日志記錄Trim Galore的Singularity鏡像用法...
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生信log46|如何尋找生信項(xiàng)目練手
經(jīng)常有人問怎么找項(xiàng)目練手，只能說把眼睛打開，學(xué)會(huì)搜索處處都是修煉場(chǎng)。 在校學(xué)生可聯(lián)系有生信分析需求的老師和實(shí)驗(yàn)室人員了； 自己復(fù)現(xiàn)領(lǐng)域經(jīng)典文獻(xiàn)里...
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生信log45|基因組數(shù)據(jù)注釋到底是怎么回事?
生信log|基因組數(shù)據(jù)注釋到底是怎么回事? 在一開始做生信分析的時(shí)候，我對(duì)下游的分析其實(shí)不太了解，當(dāng)時(shí)頻繁接觸到的概念叫“注釋”，注釋后就可獲得...
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生信log44|生信就是跑流程嗎？
在求學(xué)階段，經(jīng)常聽到老師或者沒有做生信的同學(xué)說生信就是跑流程的，一些大佬也有發(fā)文自嘲和解釋過生信不是跑流程。我自己在剛上手生信分析時(shí)，對(duì)這個(gè)說法...
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生信log43-聊聊生信就業(yè)前置技能-便利工具和延伸教程總結(jié)生信log-不學(xué)就虧了，聊聊生信就業(yè)前置技能-便利工具和延伸教程總結(jié) 強(qiáng)烈大家去《MIT計(jì)算機(jī)教育中缺失的一課》， 雖說這個(gè)是計(jì)算機(jī)的課程，但是...
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生信log42|生信數(shù)據(jù)太多怎么辦--聊聊數(shù)據(jù)存放的策略
基因組數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)量一般來說都不小，一個(gè)細(xì)菌基因組測(cè)序clean data的壓縮文件都能去到1個(gè)G，更別說其他非原核的物種了。實(shí)驗(yàn)室的數(shù)據(jù)是不能隨...
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生信log41|pdf拆頁小工具-python
因?yàn)闃I(yè)務(wù)需求，做了一個(gè)按頁數(shù)拆分pdf的小工具，本質(zhì)還是服務(wù)于數(shù)據(jù)分析的模塊 0. 思路 按指定頁數(shù)進(jìn)行拆分 處理的包：PyPDF2, clic...
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學(xué)習(xí)log5|pytorch常用模塊記錄--附示例代碼
目前網(wǎng)絡(luò)上有非常完備的訓(xùn)練框架，如抱臉蟲的transformers、達(dá)摩的modelscope,swift框架，使得模型的調(diào)用和訓(xùn)練過程都非常的...