7篇文章 · 9801字 · 6人關(guān)注
-
GWAS 總體流程理解版
自己找了一些文章和視頻，先總結(jié)了一部分，后面再做補充和實操 一. 相關(guān)概念理解 （1）GWAS： 全稱“全基因組關(guān)聯(lián)分析”，使用統(tǒng)計模型找到與性...
-
GWAS生物學相關(guān)名詞解釋
背景基因 與所研究的表現(xiàn)型直接有關(guān)的基因以外的全部基因的總稱 LD : 當位于某一座位的特定等位基因與另一座位的某一等位基因同時出現(xiàn)的概率大于群...
-
GWAS理論 1-5 全基因組關(guān)聯(lián)分析結(jié)果解讀與經(jīng)典案例介紹一、主要結(jié)果 二、結(jié)果可視化與后續(xù)分析建議 置換檢驗（Permutation test） bonferroni threshold 和 FDR...
-
GWAS理論 1-4 關(guān)聯(lián)分析模型和常用軟件介紹一、Case-Control 關(guān)聯(lián)分析模型 （第一部分主要是在人類中） 二、（動植物）數(shù)量性狀關(guān)聯(lián)分析模型 加性模型（GAM）當線性模型的種種...
-
GWAS理論 1-3 群體結(jié)構(gòu)與親緣關(guān)系評估一. 群體結(jié)構(gòu)評估 1.群體結(jié)構(gòu) 群體結(jié)構(gòu)評估內(nèi)容構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹群體結(jié)構(gòu)分析PCA（主成分分析） a.系統(tǒng)發(fā)育樹 一般 GWAS 都是種間的，用...
-
GWAS理論 1-2 表型考察處理與標記開發(fā)和分型一、表型鑒定與記錄的基本原則和原始數(shù)據(jù)處理 基因型分型基因型分型（英語：genotyping）是一個通過生物檢定法檢測某一個體的DNA序列，并對...
-
GWAS理論 1-1 全基因組關(guān)聯(lián)分析基本概念和材料選擇先把GWAS系列課程看一遍，后面再把不懂的東西再補充上來 一、概念和理論基礎 全基因組關(guān)聯(lián)分析定義 是對多個個體在全基因組范圍的遺傳變異（標記）...
