2020-12-22
寫在前面的話：第一次做微生物實驗，嘗試各種分析，踩了不少坑，雖然現(xiàn)在picrust1大有被Tax4Fun或其他功能預(yù)測方法代替的可能，但在這里還是做一下，權(quán)當(dāng)湊足工作量。

1 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

數(shù)據(jù)要求為closed reference聚類結(jié)果，具體參考官網(wǎng)教程。
http://picrust.github.io/picrust/tutorials/otu_picking.html#otu-picking-tutorial
最后獲得biom格式文件，并轉(zhuǎn)化為txt文件用于下一步

2 picrust1分析

下載picrust1可以使用conda安裝，這里圖方便直接使用Galaxy
Hutlab，網(wǎng)址為http://huttenhower.sph.harvard.edu/galaxy/
【注意】txt文件可能已經(jīng)有taxanomy，需要刪除

3 具體操作步驟

參考B站小哥的操作，細(xì)致到最后作圖
https://www.bilibili.com/video/av56508559/

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