安利我的畢業(yè)論文-關(guān)于生物信息學(xué)分析、多組學(xué)分析、機(jī)器學(xué)習(xí)的應(yīng)用

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畢業(yè)論文

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附錄A 本研究納入研究的數(shù)據(jù)下載與整理
  • 基因芯片數(shù)據(jù)下載 、整理
  • TCGA 數(shù)據(jù)的下載 、整理
  • GTEx 數(shù)據(jù)下載、整理
  • ICGC 數(shù)據(jù)下載、整理
  • CCLE 數(shù)據(jù)下載、整理
  • GTF 注釋文件下載、整理
  • 批次效應(yīng)矯正
  • PCA
  • 基因注釋
  • Venn Diagram
附錄B 加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析（WGCNA）
附錄C 差異表達(dá)分析
  • 基因芯片的差異表達(dá)分析
  • 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序（RNA-Seq）數(shù)據(jù)的差異表達(dá)分析：DESeq2、edgeR、limma
附錄D 多組學(xué)分析
  • 基因突變分析
  • DNA甲基化分析
  • 免疫浸潤(rùn)分析
附錄E 機(jī)器學(xué)習(xí)構(gòu)建模型
  • 預(yù)測(cè)模型構(gòu)建：支持向量機(jī)、隨機(jī)森林、神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)........
  • 預(yù)測(cè)模型驗(yàn)證
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