gzip是在Linux上進行解壓及壓縮的命令

$ gzip -h
Usage: gzip [OPTION]... [FILE]...
#壓縮或解壓縮文件，默認是壓縮文件，壓縮后原文件就消失了
Compress or uncompress FILEs (by default, compress FILES in-place).

Mandatory arguments to long options are mandatory for short options too.

  -c, --stdout      write on standard output, keep original files unchanged
  -d, --decompress  decompress（解壓縮）
  -f, --force       force overwrite of output file and compress links
  -h, --help        give this help
  -l, --list        list compressed file contents
  -L, --license     display software license
  -n, --no-name     do not save or restore the original name and time stamp
  -N, --name        save or restore the original name and time stamp
  -q, --quiet       suppress all warnings
  -r, --recursive   operate recursively on directories
  -S, --suffix=SUF  use suffix SUF on compressed files
  -t, --test        test compressed file integrity
  -v, --verbose     verbose mode
  -V, --version     display version number
  -1, --fast        compress faster
  -9, --best        compress better
    --rsyncable   Make rsync-friendly archive

在用gzip的時候，要解壓縮則要加入?yún)?shù)-d;一定要保證解壓縮的文件是完整的、無損壞的（如果是解壓數(shù)據(jù)，數(shù)據(jù)不完整，是會報錯的）

$ gzip -d DRR119244_1.fastq.gz
gzip: DRR119244_1.fastq.gz: unexpected end of file

另外，要提取fastq文件要4行4行的取，截取前400行

head -400 DRR119244_1.fastq | > sample.fastq

wc -l CRR126317_f1.fq.gz #查看壓縮后的行數(shù)，這個行數(shù)不一定是4的整數(shù)倍

zcat CRR126317_f1.fq.gz  #直接查看gz壓縮文件的內(nèi)容

#先輸出兩個文件的內(nèi)容，然后把內(nèi)容壓縮成一個文件
zcat Sample_test_1.R1.fastq.gz Sample_test_2.R2.fastq.gz | gzip - > test.fastq.gz
#要比zcat快
cat Sample_test_1.R1.fastq.gz Sample_test_2.R2.fastq.gz > test2.fastq.gz

tar -xzvf .tar.gz
      tar [-cxtzjvfpPN] 文件與目錄 .... 
      參數(shù)： 
      -c ：建立一個壓縮文件的參數(shù)指令(create 的意思)； 
      -x ：解開一個壓縮文件的參數(shù)指令！ 
      -t ：查看 tarfile 里面的文件！ 
      特別注意，在參數(shù)的下達中， c/x/t 僅能存在一個！不可同時存在！ 
      因為不可能同時壓縮與解壓縮。 
      -z ：是否同時具有 gzip 的屬性？亦即是否需要用 gzip 壓縮？ 
      -j ：是否同時具有 bzip2 的屬性？亦即是否需要用 bzip2 壓縮？ 
      -v ：壓縮的過程中顯示文件！這個常用，但不建議用在背景執(zhí)行過程！ 
      -f ：使用檔名，請留意，在 f 之后要立即接檔名喔！不要再加參數(shù)！