關(guān)于陳洪綬的去世，傳記的說法均是“以疾卒”，后來則又冒出“不良死”（即“黃祖之禍”，受迫害致死）一說，于是他的死亡漸漸成為一個(gè)謎。

“以疾卒”的記載
孟遠(yuǎn)《陳洪綬傳》：“歲壬辰，忽歸故里，日與昔時(shí)交友，流連不忍去。一日趺坐床簀，瞑目欲逝。子?jì)D環(huán)哭，忽戒：‘無哭，恐動(dòng)吾掛礙心。’喃喃念佛號(hào)而卒?！?br> 朱彝尊《崔子忠與陳洪綬合傳》：陳氏“以疾卒”。
《清史稿本傳》：“鼎革后……語及亂離，輒慟哭，后數(shù)年卒?！?br> 陳傳席1989年出版的書中對(duì)陳洪綬的死寫道：“順治九年（1652）初，陳洪綬離別是非之地杭州，回到紹興，大概他已感到氣力不逮，一日，坐在床上，閉目念著佛學(xué)……默默地離開了人世?！?/p>