源井KO細胞助力發(fā)現(xiàn)新型TNFR1肽類抑制劑—FKC肽

前言

腫瘤壞死因子(TNF)是一種重要的炎癥反應(yīng)調(diào)節(jié)因子,然而,TNF的過度產(chǎn)生或異?;钚钥赡軐?dǎo)致一系列自身免疫疾病。目前針對TNF的療法雖然有效,但存在一些缺點。這些治療方法成本高昂,而且可能會引起嚴重的不良副作用。因此,特異性地靶向其受體TNFR1而不是TNF,可能是一種更有效且副作用更小的治療策略。

近日,Chih?Hung?Lo團隊在PNAS雜志(IF=11.1)上發(fā)表了題為“Peptide-based allosteric inhibitor targets TNFR1 conformationally active region and disables receptor–ligand signaling complex”的研究論文。該研究發(fā)現(xiàn)FKC作為一種變構(gòu)抑制劑,通過結(jié)合TNFR1并擾亂受體的構(gòu)象動態(tài),而不是通過阻斷受體-配體相互作用或破壞受體-受體相互作用,實現(xiàn)了對TNFR1信號的抑制。這種機制為開發(fā)新型非競爭性抑制劑提供了新的視角,并為針對TNFR1的特異性抑制開辟了新的途徑。該研究采用源井生物提供的TNFR1基因敲除HEK293細胞研究FKC肽對TNFR1信號通路的特異性影響。

FKC肽與TNFR1的相互作用及受體構(gòu)象變化

研究者發(fā)現(xiàn)FKC肽(FKCRRWQWRMKK)能夠與TNFR1相互作用,并誘導(dǎo)受體的構(gòu)象變化。通過使用TNFR1的FRET(熒光共振能量轉(zhuǎn)移)生物傳感器,研究者觀察到FKC肽以劑量依賴性方式降低了FRET效率,表明FKC改變了TNFR1的構(gòu)象狀態(tài)。FKC肽對TNFR1的TNFR2同源體沒有影響,表明FKC肽與TNFR1的相互作用具有特異性。

FKC肽抑制TNFR1信號傳導(dǎo)的特異性

FKC肽在HEK293細胞中以劑量依賴性方式抑制了TNF誘導(dǎo)的IκBα磷酸化、降解以及NF-κB成分p65的磷酸化,這些都是TNFR1信號通路的關(guān)鍵步驟。使用熒光素酶報告基因分析,F(xiàn)KC肽抑制了TNF誘導(dǎo)的NF-κB激活,半抑制濃度(IC50)為27 μM。在TNFR1基因敲除HEK293細胞由源井生物構(gòu)建中,F(xiàn)KC肽不影響基礎(chǔ)NF-κB活性,證明了FKC肽對TNFR1信號通路的特異性抑制作用。?????


圖1 FKC肽以受體特異性的方式抑制TNFR1信號通路。


FKC肽在體內(nèi)減輕炎癥的效果

研究者使用腹腔注射TNF的小鼠模型來模擬炎癥反應(yīng),并評估FKC肽的效果。FKC肽治療能顯著降低TNF誘導(dǎo)的多種炎癥因子(如TNF、MCP-1、IFN-γ、IL-1α、IL-1β和IL-6)在小鼠血漿中的水平。FKC肽減少了TNF誘導(dǎo)的肝臟、腎臟和肺中CD68陽性細胞的數(shù)量,表明其減輕了巨噬細胞的激活。

FKC肽靶向TNFR1的構(gòu)象活性區(qū)域并擾亂受體動態(tài)

研究者使用計算方法確定FKC肽與TNFR1的結(jié)合位點,發(fā)現(xiàn)FKC肽穩(wěn)定地結(jié)合在TNFR1二聚體的CRD2/3附近,這是受體的構(gòu)象活性區(qū)域。FKC肽的結(jié)合減少了TNFR1的CRD2/3和CRD4結(jié)構(gòu)域的動態(tài)變化,導(dǎo)致受體采取開放和非活性的構(gòu)象,阻礙了下游信號分子的招募。

FKC肽的變構(gòu)抑制機制

FKC肽作為變構(gòu)抑制劑,不通過阻斷配體結(jié)合或破壞受體間相互作用來發(fā)揮作用。受FKC肽甚至能夠防止其他小分子(如Zafirlukast)破壞TNFR1的受體間相互作用。


圖2 機理示意圖

結(jié)論

研究結(jié)果表明,F(xiàn)KC肽通過特異性靶向TNFR1的構(gòu)象活性區(qū)域,以非競爭性的方式抑制TNFR1信號傳導(dǎo),減輕炎癥反應(yīng)。該項研究提供了針對TNFR1構(gòu)象活性區(qū)域靶向治療的可行性證據(jù),并為開發(fā)更有效、成本更低的TNFR1抑制劑提供了新的方向。

參考文獻:

Zeng, Jialiu et al. “Peptide-based allosteric inhibitor targets TNFR1 conformationally active region and disables receptor-ligand signaling complex.” Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America vol. 121,14 (2024): e2308132121.

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