學習小組Day5筆記-云朵

數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)

一、新手必備重點知識(來源:微信公眾號 生信星球)

(1)R的賦值符號不是等號,而是<-

(2)在Console 控制臺輸入命令,相當于Linux的命令行

(3)R的代碼都是帶括號的,括號必須是英文的。

(4)顯示工作路徑 getwd()

(5)向量是由元素組成的,元素可以是數(shù)字或者字符串。

(6)表格在R語言中改名叫數(shù)據(jù)框_

(7)別只復制代碼,要理解其中的命令、函數(shù)的意思。函數(shù)或者命令不會用時,除了百度/谷歌搜索以外,用這個命令查看幫助:

?read.table
調(diào)出對應的幫助文檔,翻到example部分研究一下。

(8)數(shù)據(jù)類型(重點只有兩個,剩下的不看)

向量(vector)??重要

矩陣(Matrix)

數(shù)組(Array)

數(shù)據(jù)框(Data frame)??重要

List

part1:向量

二、標量和向量的區(qū)分

變量包含標量和向量

1、元素指的是數(shù)字或者字符串(用chr表示)等

標量:一個元素組成的變量;

向量:多個元素有序排列組成的變量,一個向量可以作為數(shù)據(jù)框中的一列。

2、使用前要給變量賦值

如:x<- c(1,2,3) #常用的向量寫法,意為將x定義為由元素1,2,3組成的向量。

Tips:

1、重復賦值會覆蓋上一次賦值,x的定義以最后一次賦值為準,此時x為1 2 3 1 2 3
2、變量名可以為別的字母

三、從向量中提取元素

1、根據(jù)值來提取

x[4] #x第4個元素
x[-4]#排除法,除了第4個元素之外剩余的元素
x[2:4]#第2到4個元素
x[-(2:4)]#除了第2-4個元素
x[c(1,5)] #第1個和第5個元素

1、根據(jù)位置來提取

x[x==10]#等于10的元素
x[x<0]
x[x %in% c(1,2,5)]#存在于向量c(1,2,5)中的元素
截屏2021-11-20 上午8.48.05.png

Part2:數(shù)據(jù)框

將示例數(shù)據(jù)放在工作目錄下

一、讀取本地數(shù)據(jù)

1、
讀取并將數(shù)據(jù)賦值給a

用幫助文檔查看sep和header的意思

sep:數(shù)據(jù)的分隔符,
header:預示著文件是否包含變量名稱作為第一行的邏輯值
幫助文檔

二、設置行名和列名

X<-read.csv('doudou.txt') #在示例數(shù)據(jù)里有doudou.txt 注意這里的變量X是一個數(shù)據(jù)框
colnames(X) #查看列名
rownames(X) #查看行名,默認值的行名就是行號,1.2.3.4...
colnames(X)[1]<-"bioplanet"#有的公司返回數(shù)據(jù),左上角第一格為空,R會自動補為x,用這個命令來修改
X<-read.csv(file = "huahua.txt",sep = " ",header =T,row.names=1)#最后row.names的意思是修改第一列為行名
注意嚴格區(qū)分字母大小寫

三、數(shù)據(jù)框的導出

write.table(X,file = "yu.txt",sep = ",",quote=F)#分隔符改為逗號,字符串不加雙引號(默認格式帶由雙引號)

已導出數(shù)據(jù)框

四、變量的保存與重新加載

這次沒有處理完的數(shù)據(jù)可以保存和重新加載。保存的格式是RData。

save.image(file="bioinfoplanet.RData")#保存當前所有變量
save(X,file="test.RData")#保存其中一個變量
load("test.RData")#再次使用RData時的加載命令
工作目錄下保存的數(shù)據(jù)

五、提取元素(來源:微信公眾號 生信星球)

  • X[x,y]#第x行第y列
  • X[x,]#第x行
  • X[,y]#第y列
  • X[y] #也是第y列
  • X[a:b]#第a列到第b列
  • X[c(a,b)]#第a列和第b列
  • X$列名#也可以提取列(這個命令不用寫括號的地步,并且支持Tab自動補全哦,不過只能提取一列)

六、直接使用數(shù)據(jù)框中的變量

plot(iris$Sepal.Length,iris$Sepal.Width)

散點圖

保存到工作目錄下

七、save(X,file="test.RData")這句代碼如果報錯object X not found

原因可能是文件的路徑錯了,路徑應該放在工作目錄下

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