合作文章|ChIP-seq與RNA-seq聯(lián)合解析:甲硫氨酸限制通過H3K4me3-IRF1軸調(diào)控巨噬細(xì)胞極化緩解腎IRI

1?文章信息

文章標(biāo)題:Methionine restriction attenuates renal injury by suppressing macrophage polarization via IRF1

downregulation

文章主題:限制蛋氨酸攝入通過下調(diào)IRF1抑制巨噬細(xì)胞極化從而減輕腎損傷

發(fā)表期刊:Food &Function

影響因子:5.4

作者信息:華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院附屬同濟(jì)醫(yī)院陳知水研究團(tuán)隊(duì)

提供的組學(xué)技術(shù):ChIP-seq

2?研究背景

腎缺血-再灌注損傷(IRI)是急性腎損傷(AKI)的常見原因,可導(dǎo)致炎癥反應(yīng)和組織損傷,而巨噬細(xì)胞在其中扮演關(guān)鍵角色——其M1型極化促進(jìn)炎癥,M2型參與修復(fù);近年來,甲硫氨酸限制(MR)作為一種代謝干預(yù)策略,在抗衰老和抗炎領(lǐng)域顯示出潛力,但其在腎IRI中是否通過調(diào)控巨噬細(xì)胞極化發(fā)揮保護(hù)作用及其分子機(jī)制尚不清楚。

3?研究思路

4?研究結(jié)論

該研究結(jié)合RNA-seq與ChIP-seq等組學(xué)技術(shù),發(fā)現(xiàn)甲硫氨酸限制(MR)通過降低S-腺苷甲硫氨酸(SAM)水平,減少Irf1基因啟動(dòng)子區(qū)域的H3K4me3激活型組蛋白修飾,從而在表觀遺傳層面抑制干擾素調(diào)節(jié)因子1(IRF1)的表達(dá)。這一機(jī)制顯著削弱了巨噬細(xì)胞向促炎M1表型的極化,進(jìn)而減輕腎缺血-再灌注損傷。綜合功能驗(yàn)證與多組學(xué)分析,得出結(jié)論:MR通過IRF1–H3K4me3軸調(diào)控巨噬細(xì)胞極化,在腎IRI中發(fā)揮凈保護(hù)作用,為代謝干預(yù)治療急性腎損傷提供了新思路。

5?結(jié)果展示

圖1 巨噬細(xì)胞預(yù)耗竭改變M1/M2比值
圖2 甲硫氨酸循環(huán)抑制通過抑制IRF1影響巨噬細(xì)胞極化
圖3 甲硫氨酸限制會損害腎缺血-再灌注損傷中的巨噬細(xì)胞極化
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