說明：
在最近的學(xué)習(xí)中完成了對基因家族分析流程的熟悉，因此想借助簡書平臺記錄自己的學(xué)習(xí)過程。由于對基因組學(xué)只是剛剛?cè)腴T，還存在很多不熟悉的東西，因此若存在理解錯誤的地方，歡迎交流討論。
基因家族：
在這里，我就按照教科書標(biāo)準(zhǔn)體系去闡述這一專題，僅僅談?wù)勛约旱睦斫?。個人認(rèn)為對于這個概念的理解一定繞不開曾在大二的生物化學(xué)學(xué)到過的旁系同源和直系同源基因的概念。這倆玩意兒說實(shí)話一開始理解起來挺吃力的，根源在于他們的修飾詞上。用通俗的話講，當(dāng)時的我認(rèn)為旁系的旁那不就是指不同物種間，直系自然是同一物種間。但接觸他們的定義時，卻發(fā)現(xiàn)恰恰相反。
在對下面這張圖以及各大論壇的大神的話思考很久后，我大概有了這種理解：“旁”可能得理解為在旁邊，意為物種內(nèi)由于各種因素的影響（在進(jìn)化過程中我覺得大部分情況下是為了適應(yīng)環(huán)境，詳見后文）下基因的騷操作給自己
整出了一堆哥們兒來，就在漫長的DNA分子鏈上陪伴自己，執(zhí)行任務(wù)，大家都是相親相愛的一家族人。不知大伙看過《權(quán)力的游戲》沒有，比如上面這個血紅蛋白家族就像是史塔克家族。大家都秉承著史塔克家族的榮耀，守護(hù)北境，但是有些人成為了守夜人，有人成為了三眼烏鴉的繼承人，大伙都是一個媽生的，最后走向不同，這也就體現(xiàn)了旁系同源的特點(diǎn)。直系同源大體可以把它理解為在新物種形成時繼續(xù)保留了原有功能的基因，這可能是為了偷懶，就像是你使用數(shù)學(xué)公式一樣，一般很少有人在使用高斯定理前先寫上它的證明過程吧？直接拿過來用，至于怎么變式以適應(yīng)解題需要是得考慮的，但還是那個模樣，所謂萬變不離其宗。
在了解了上面?zhèn)z概念后，基因家族也就呼之欲出了。我認(rèn)為對于這個詞值得關(guān)注的有這么幾點(diǎn)：
1.序列的相似性。這應(yīng)該是一切對于這個家族生信分析的基礎(chǔ)，是分析成立的根本。沒有這個論點(diǎn)一切關(guān)于基因家族建立的數(shù)學(xué)模型都是空中樓閣，所以這是最重要的。
2.功能相似性、相異化或無功能化。同一基因家族的基因按照常理來講應(yīng)當(dāng)具備相似功能，畢竟一級結(jié)構(gòu)影響二、三級結(jié)構(gòu)，結(jié)構(gòu)又與功能密切相關(guān)。個人認(rèn)為這種功能的重復(fù)性對于生物體是挺有好處的，一方面當(dāng)某個成員的基因發(fā)生突變無法表達(dá)了，還有其它成員幫它填坑，另一方面是適應(yīng)生物體形體增大以實(shí)現(xiàn)不同組織的特異性表達(dá)，不同組織可能需要基因去發(fā)展一些額外技能，你總不能讓一個基因抗這么多擔(dān)子呀，不是誰都有一個uncle ben的，所以發(fā)展了一個家族的成員。當(dāng)然，由于突變的累積（如非同義突變等），有些基因可能就不干了，開始摸魚了，五險(xiǎn)一金保證不了那怎么行？
3.數(shù)量變化可多可少。基因家族的成員并非隨著進(jìn)化而增多，有可能在進(jìn)化過程中會減少。有時候并不是人多才好，適合的才重要。
