一個基因包括外顯子和內(nèi)含子部分，有時候我們需要了解基因包含的具體外顯子位置信息。確定的方法有很多種，比如NCBI、USUC和Blast等。這里我們用NCBI的方法找到一個基因的外顯子序列。
首先打開NCBI網(wǎng)站，https://www.ncbi.nlm.nih.gov/,
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選擇“gene”數(shù)據(jù)框，搜索框內(nèi)敲入基因名字“EML4”。
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在“search results”頁面會出現(xiàn)多個結(jié)果，我們選擇后面括號注明是Homo sapiens的選項。
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打開界面，可以看到EML4基因的summary信息。包括基因的全名，曾用名，基因名會隨著版本的升級而變化，每個基因名對應(yīng)一個GeneID,這個ID是唯一的。
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往下面看，在基因的regions，transcripts and products界面內(nèi)，可以看到這個基因的mrna和編碼蛋白的編號.NM_開頭的序列都是Mrna序列。記住這個Mrna的編號。
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接下來介紹一個線上的軟件，Splign，網(wǎng)址是https://www.ncbi.nlm.nih.gov/sutils/splign/splign.cgi?textpage=online&level=form
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可以用Mrna或EST序列與所在的基因組序列比對，可以顯示基因的結(jié)構(gòu)。比對結(jié)果顯示EML4有22個外顯子，有對應(yīng)的基因組比對的序列，明確外顯子在Mrna序列上的區(qū)域。
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