發(fā)簡信
IP屬地：吉林
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ENCODE ChIP-seq數(shù)據(jù) | 從下載到分析很久不見。錯(cuò)過了很多的詢問和回復(fù)，很抱歉。這段時(shí)間在整理我的第一篇paper，大部分涉及的東西不太具有可分享性（其實(shí)也是應(yīng)該記錄的）——————...
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環(huán)狀DNA (eccDNA)分析學(xué)習(xí)筆記
最近在學(xué)習(xí)當(dāng)下很火的環(huán)狀DNA（eccDNA）的建庫技術(shù)以及生信分析，特此記錄。 No.1 去低質(zhì)量&去接頭 這一步需要注意的是低質(zhì)量堿基的qu...
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如何統(tǒng)計(jì)測序文件的reads長度分布記錄今天學(xué)會(huì)的一個(gè)小知識(shí)：統(tǒng)計(jì)測序文件的reads長度分布 由于某些原因，需要統(tǒng)計(jì)reads長度分布對(duì)建庫方法進(jìn)行質(zhì)控，對(duì)測序數(shù)據(jù)進(jìn)行可用與否的...
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單細(xì)胞測序分析學(xué)習(xí)筆記
這一筆記的主要目的是記錄學(xué)習(xí)和實(shí)踐過程，所寫皆嘗試過為可用操作，看到的各位小伙伴有更好的操作歡迎隨時(shí)交流~ 1. 創(chuàng)建 R 4.0以上的con...
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喜歡的音樂記錄發(fā)現(xiàn)年紀(jì)越大越容易不記得事情，以前記在本子上，收藏夾里的回憶都因?yàn)檎也坏奖咀印Q了電腦而丟失，再想回去看看時(shí)，幾番尋找都再得不到。凡此過往，皆為...
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科研實(shí)驗(yàn)成功指南 | 低濃度質(zhì)粒真的包不好慢病毒嗎？今天要記錄一個(gè)很實(shí)用的實(shí)驗(yàn)技巧：如題，怎么利用低濃度的質(zhì)粒包好慢病毒嗎？ 慢病毒已經(jīng)成為目前生命科學(xué)領(lǐng)域一個(gè)很常用的進(jìn)行基因表達(dá)調(diào)控的實(shí)驗(yàn)方法了...
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生信-單細(xì)胞分析 | scATAC分析踩坑記錄課題需要某一篇已發(fā)表文章的基于10x Genomics平臺(tái)的scATAC-seq數(shù)據(jù)，于是乎，開始了踩坑指南。 No.1 數(shù)據(jù)下載 眾所周知，公...
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Neuronscience | How to choose correct brain cell lines for your research今天這篇筆記主要是記錄一些查找的腦細(xì)胞系相關(guān)的資料。 接下來需要進(jìn)行一些細(xì)胞系的實(shí)驗(yàn)，因此在查找合適的已經(jīng)建好的能夠在體外培養(yǎng)的human br...
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科研實(shí)用技能 | 運(yùn)用軟件分析snp，indel等之后如何設(shè)計(jì)引物進(jìn)行驗(yàn)證呢最近在做一批樣本，是基于大規(guī)?；蚪M測序?qū)ふ倚碌募膊∠嚓P(guān)突變位點(diǎn)（snv）和indel等的。 軟件給出的結(jié)果一般都是以下形式，給出的只有突變所在...