
上圖所示的石蠟切片中,包含多種細(xì)胞類型,但我只想框定一個范圍對特定細(xì)胞類型(導(dǎo)管)進(jìn)行統(tǒng)計分析,在ImageJ中怎么操作:
1.將圖片拖拽到ImageJ界面打開
2.將圖片轉(zhuǎn)為灰度圖
ImageJ菜單欄中Image--Type--8bit
圖片2.jpg
ImageJ--Adjust--Threshold在彈出的框中輕微拉動滑條調(diào)整,讓細(xì)胞與細(xì)胞之間的界線更加清楚,不要有紅色粘連 ,對比兩幅圖,第2張為調(diào)整之后,細(xì)胞之間的界線更加清晰。
圖片4.jpg
圖片5.jpg
調(diào)整好后關(guān)掉小窗口--點(diǎn)擊菜單欄第一個矩形框--框出想要統(tǒng)計的范圍
框好后,Ctrl+T--more--specify--設(shè)定框的大小--OK
圖片6.jpg
計算 Analyze--Analyze Particles--第一個框是設(shè)定大小,第二個是設(shè)置圓的曲率,如果默認(rèn)參數(shù),就會出現(xiàn):被紅色標(biāo)記的所有細(xì)胞都被計數(shù)并計算面積。
圖片8.jpg
解決方法:在步驟3,調(diào)整好細(xì)胞輪廓的邊界后,先用菜單欄中的第四個多邊形工具,描繪出想要框定范圍內(nèi)的,最小的細(xì)胞,或者最大的細(xì)胞,點(diǎn)擊M測量。
我這里想統(tǒng)計面積較大的導(dǎo)管,所以描出范圍中看著最小的導(dǎo)管,得到一個最小面積界定。記下來用于設(shè)定size。
再進(jìn)行步驟4的操作。
圖片9.jpg
圖片10.jpg
這樣就可以只篩選框定范圍內(nèi)的特定的導(dǎo)管細(xì)胞的面積,和個數(shù)。
Results中展示統(tǒng)計的細(xì)胞數(shù)目,面積信息,一次設(shè)置不好,可以叉掉Results,返回步驟5進(jìn)行重新調(diào)整參數(shù)。
整理記錄一下,希望可以幫助到更多的人
另外,ImageJ在操作過程中怎么撤銷上一步的操作呢?一直沒有找到撤銷的快捷鍵或者方法。。。。。。






