糖酵解相關(guān)基因

背景

作者通過(guò)對(duì)正常/癌旁與腫瘤組織進(jìn)行GSEA分析發(fā)現(xiàn)5個(gè)糖酵解相關(guān)通路（glycolysis）在腎透明細(xì)胞癌（ccRCC）中都有顯著差異，因此作者想研究下糖酵解相關(guān)基因?qū)cRCC的影響。

結(jié)果

1.GSEA+差異分析

• 作者選取5個(gè)糖酵解相關(guān)通路，以FDR < 0.25 作為閾值，表明ccRCC確實(shí)與糖酵解有關(guān)。
• 288糖酵解相關(guān)基因→差異分析→unicox+PPI

Fig 2

Fig 3

2.模型構(gòu)建

Fig 4

Fig 5

Fig 6

3.模型驗(yàn)證

• 收集78例ccRCC病例驗(yàn)證

  
  
  Fig 8

• GSE22541驗(yàn)證

  
  
  Fig 9

4.模型周邊-藥物敏感性和免疫反應(yīng)性

作者用 E-MTAB-3267（53例）和 E-MTAB-3218（59例）直接驗(yàn)證模型對(duì)藥物敏感和免疫治療的反應(yīng)性，這點(diǎn)非常值得借鑒。

Fig 10

感悟

通過(guò)真實(shí)檢測(cè)隊(duì)列查看模型對(duì)藥物敏感性和免疫治療的反應(yīng)性，值得借鑒。

參考鏈接：
Identification of a Novel Glycolysis-Related Gene Signature Correlates With the Prognosis and Therapeutic Responses in Patients With Clear Cell Renal Cell Carcinoma