1. 該裝anaconda還是miniconda？
anaconda可以認(rèn)為是一個(gè)完整版本的conda，里面有很多已經(jīng)裝好的軟件，miniconda是精簡(jiǎn)版，里面什么都沒裝，所有想用的軟件都是現(xiàn)用現(xiàn)裝，推薦裝miniconda。
2. miniconda的安裝
MacOS:
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-MacOSX-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-MacOSX-x86_64.sh
Linux:
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
Win10 bash:
wget https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-4.3.21-Linux-x86_64.sh
bash Miniconda3-4.3.21-Linux-x86_64.sh
一頓yes之后，就可以了。關(guān)閉terminal再重新打開，輸入conda，應(yīng)該會(huì)顯示很多選項(xiàng)。
3. 激活bioconda:
conda config --add channels r
conda config --add channels conda-forge
conda config --add channels bioconda
上述命令只需運(yùn)行一次即可，以后都不用再運(yùn)行這些了。
4. 更新conda:
首先要deactivate conda:
source deactivate
然后更新conda:
conda update conda
5. 使用conda:
創(chuàng)建一個(gè)名為bioinfo的environment:
conda create -y --name bioinfo python=3.7
然后激活bioinfo:
source activate bioinfo
裝一個(gè)軟件合集（來自biostar handbook）:
curl http://data.biostarhandbook.com/install/conda.txt | xargs conda install -y
如果以后需要裝這個(gè)軟件合集里沒有的軟件，則只需：
conda install toolname
即可。
6. 更新biostar handbook提供的軟件合集（推薦一年一次）：
curl http://data.biostarhandbook.com/install/conda.txt | xargs conda upgrade
