陳巍學(xué)基因視頻學(xué)習(xí)筆記--視頻10:?jiǎn)渭?xì)胞DNA測(cè)序

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陳巍學(xué)基因視頻學(xué)習(xí)筆記--視頻8:外顯子測(cè)序
陳巍學(xué)基因視頻學(xué)習(xí)筆記--視頻9:small RNA-seq

單細(xì)胞DNA測(cè)序的目的就是要一個(gè)細(xì)胞能做到全基因組測(cè)序。

要克服的困難:
(1)隨機(jī)引物PCR擴(kuò)增,由于擴(kuò)增效率不同,則擴(kuò)增不均一;
(2)全基因組覆蓋問(wèn)題:常規(guī)的打斷,加接頭等操作會(huì)損失DNA,這是不可接受的,這里要求幾乎所有的原始DNA都要被擴(kuò)增并且檢測(cè)到。
(3)要有較高的擴(kuò)增效率:普通的方法,2萬(wàn)個(gè)文庫(kù),只有一個(gè)會(huì)被結(jié)合在flowcell上。

解決辦法:
(1)MALBAC:均一性更好,擴(kuò)增效率相對(duì)較低


image.png

(2)MDA:擴(kuò)增效率高,簡(jiǎn)單


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互相比較:

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由于單細(xì)胞測(cè)序在近幾年得到了爆炸性的進(jìn)步,因此對(duì)于2015年的視頻,我則是不看那么詳細(xì)了。

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