一、Miniconda是什么?
Miniconda是一款生信相關(guān)的應(yīng)用商店。
二、Miniconda的安裝
1、安裝前首先在xshell中使用uname -a命令查看服務(wù)器是多少位的
2、cd biosoft進(jìn)入昨天建立的目錄
3、wget加鏈接下載
4、source ~/.bashrc激活
5、conda出現(xiàn)很多信息證明激活成功
6、添加鏡像
# 使用清華鏡像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
conda config --set show_channel_urls yes
三、Miniconda的使用
1、conda list查看軟件列表
2、conda search搜索軟件
3、conda install fastqc -y安裝軟件
4、conda remove fastqc -y卸載軟件
5、conda info --envs查看環(huán)境