生物信息學入門

大三上學期的時候看網(wǎng)課和參考書自學了Linux系統(tǒng),并且在實驗室?guī)熜值难b了CentOS 7.0的電腦上實操了幾天,也算是勉強入了門。在看了山東大學的生物信息學課后,我打算再看一遍一位17級的學長推薦給我的課程(鏈接如下),雖然已經(jīng)看過一遍了,但溫故知新,這次想再細致學一遍。
生物信息快速入門

illumina測序技術的優(yōu)勢

1.可逆阻斷終止技術
2.邊合成邊測序
3.雙末端測序

樣品要求

1.最好為單倍體(故人與動物大多用紅細胞)
2.達到DNA純度要求OD值
3.樣品未降解
4.樣品量滿足建庫要求

文庫構建

1.加A堿基,進行末端修復
2.加測序引物
3.加index
4.加adapter

illumina測序數(shù)據(jù)特點

1.測序覆蓋全基因組
2.測序數(shù)據(jù)讀長短
3.測序數(shù)據(jù)具有一定的錯誤率
4.測序數(shù)據(jù)深度高
5.測序數(shù)據(jù)具有pair-end關系

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