wolai | 用wolai+Zotero搭建文獻管理

來源:我的文獻管理截圖


最近一直在分享wolai,陸續(xù)分享了我用wolai做的讀書管理、晨間日記、動漫屋、人脈管理的模板。

沒看過的可以去回顧一下~

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作為一個科研狗,這次終于輪到分享科研中的文獻管理了。

先說說我在文獻管理中遇到的問題:

我之前折騰過的文獻管理軟件有endnote,Zotero,mendeley,citavi,noteexpress。

endnote是老牌文獻管理軟件了,基本上用的人偏多,很多學校購買的也都是endnote的版權(quán),但是endnote使用起來有諸多不便,沒有好用的文獻抓取插件,導入就很麻煩,筆記功能比較弱,有些臃腫;優(yōu)點是有自帶的閱讀器,界面還好吧。

Zotero今年出了自帶閱讀器,雖然還是beta版,但是已經(jīng)不錯了,在瀏覽器中搜索時,有插件可以直接抓取文獻到客戶端,輕便,反應(yīng)速度快。Zotero因為是開源軟件,所以有各路大神做了很多附加功能,可以搭建的空間比較大。

mendeley當初沒有深度使用過,不過它也有內(nèi)置閱讀器,也有抓取文獻的插件(其實不太能稱之為插件,和其它瀏覽器插件性質(zhì)不太一樣)。

citavi堪稱瑞士軍刀,講真,至今都覺得citavi基本完成了文獻管理的全流程,但是也有很多槽點,響應(yīng)慢,肉眼可見的慢,臃腫笨重,本來是想好好搗鼓一下citavi,作為長期使用的一款文獻管理軟件,結(jié)果后來莫名其妙出了一個bug,我沒解決掉,加上一直使用endnote比較多,后來干脆卸載了citavi。。。

noteexpress因為是國產(chǎn)文獻管理軟件,對中文文獻比較友好,優(yōu)點是可以顯示影響因子,這個功能是其他軟件沒有的。不過我實在是個顏狗,endnote和noteexpress對比,我還是喜歡endnote的界面,所以最終也沒有深度使用noteexpress。

因為有些我沒有深度使用,所以以上各個軟件優(yōu)缺點僅供參考。

總結(jié)一下,以上軟件的筆記功能都很弱,沒辦法在軟件內(nèi)隨意進行引用和雙鏈。

所以,考慮利用wolai的雙向鏈接+數(shù)據(jù)表格搭建一個文獻管理。

需要說明一下,因為wolai是知識管理軟件,并沒有文獻抓取和管理功能,所以需要和其他軟件搭配使用,這里介紹的是wolai和Zotero的搭配使用,因為Zotero抓取確實很爽!加上今年出的閱讀器,目前算是比較喜歡的一款了。

先來分享一下我的文獻管理模板。

依舊采用了數(shù)據(jù)表格形式,字段包含year,author,title,journal,IF(影響因子),state(閱讀狀態(tài)),note(備注),link,corresponding author,field(相當于領(lǐng)域或者關(guān)鍵詞),rating,doi,type(document/review)

如果文獻管理軟件里的文獻量不是超級大的話,基本上用year+author就能快速定位到文獻,我每次在軟件里找文獻也是利用這兩個字段。

所以和文獻管理軟件中一樣,我把year和author放在了開頭,title是第三列。

用模板中的文獻舉例:

2021年sadler發(fā)表的Transient receptor potential canonical 5 mediates inflammatory mechanical and spontaneous pain in mice

journal:science translantional medicine

IF:17.956 ?所以我直接設(shè)置了15-20的區(qū)間

state:表示閱讀狀態(tài),done讀完,reading在讀,to read待讀

corresponding author:一般文獻都比較注重通訊作者是誰,所以加了這個字段

field:所屬領(lǐng)域或者關(guān)鍵詞,比如這篇文獻屬于pain

rating:這個是自己對于這篇文獻重要程度的評價,一星到五星

type:分document和review。我基本只讀這兩類文獻,所以只區(qū)分了這個,如果是讀RCT和Meta-Analysis之類的比較多,可以直接采用pubmed里的分類:

我目前想到的是這些,可以根據(jù)自己的習慣增刪或者拖動調(diào)整位置,比如:如果比較關(guān)注通訊作者,就把corresponding author往左邊再拖一拖

點擊title后,可以看到該篇文獻的筆記。

思考里面包含了三個問題:

主要講了什么?對我有什么用?創(chuàng)新之處?

這個僅供參考,可以自己修改。

further reading:輻射閱讀/延伸閱讀,就是看完這篇文獻,需要看哪些相關(guān)文獻,可以列到這里,或者和已有筆記進行雙鏈

其余就是文獻的部分了,順序分別是abstract,introduction,results,discussion,methods,academic phrasebank,references

因為我讀文獻基本是這個順序,先大概看摘要和introduction,然后就是results,其實比較關(guān)注的就是這些,其余都是補充信息了。

academic phrasebank是語料庫,可以積累該篇文獻的金句/范句。

考慮到results可能有小標題,所以以上幾個我都全部采用了大標題,嫌字號太大的可以改成中標題。

以上就是我的文獻管理模板了,一篇筆記做完之后,可以復(fù)制鏈接,在Zotero中選中該篇文獻,點擊右鍵,添加附件,附加url的鏈接,然后就把wolai 的文獻筆記和Zotero里的文獻進行了關(guān)聯(lián)。

點擊Zotero里的筆記鏈接,會在瀏覽器中打開wolai的筆記,如果習慣使用的是wolai網(wǎng)頁版,那么這個關(guān)聯(lián)也相當不錯了。(不過我習慣用wolai客戶端,哈哈哈)

因為數(shù)據(jù)表格也剛出一個月,各項模板都還在優(yōu)化中,所以我目前文獻管理還沒有用wolai做,不過之前寫關(guān)于睡眠的文章時,都是在wolai里整理的。

wolai沒有類似于Wikipedia的尾注功能,如果有的話,簡直都可以直接在wolai里寫論文了。

wolai+Zotero搭建文獻管理的好處:

有雙鏈,從上面那個截圖可以看出,一旦積累出多篇文獻筆記,好處就會顯現(xiàn)出來,這使得同主題多篇文獻的關(guān)聯(lián)相當方便,比如我可以很方便的看出哪些筆記里包含了“社交時差”;同時,還可以在wolai中搭建科研管理系統(tǒng),如果文獻管理也在wolai中做,那么就可以和實驗的筆記結(jié)合起來,這是比較爽的!

有數(shù)據(jù)表格,對于文獻狀態(tài),評價等管理起來都比較方便,可以建立起讀文獻的工作流

缺點:以上這套文獻管理采用了兩款軟件,還是比較割裂,很多筆記需要旁邊有圖,有可能筆記工作量會比較大。

各有優(yōu)缺點,不可能有完美的軟件,所以還是需要根據(jù)需求搭建出適合自己的,以上僅供參考啦。

wolai模板中心里也有兩個文獻筆記模板,可以參考一下~

點擊下方鏈接,可以直接把我的文獻管理模板復(fù)制到自己的wolai里,喜歡的可以拿去試試~

https://www.wolai.com/kGZ7JoEjfU9sS8yJwyhG1J

真的好希望有一款雙向鏈接+數(shù)據(jù)表格的文獻管理軟件橫空出世!

哎,我也就只能做夢想想。。。

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