RNA、mRNA、tRNA、rRNA有何區(qū)別及功能?
CDS是Coding sequence的縮寫,是編碼一段蛋白產(chǎn)物的序列,是結(jié)構(gòu)基因組學(xué)術(shù)語
ORF開放閱讀框是基因序列的一部分,包含一段可以編碼蛋白的堿基序列,不能被終止子打斷.當(dāng)一個(gè)新基因被識(shí)別,其DNA序列被解讀,人們?nèi)耘f無法搞清相應(yīng)的蛋白序列是什么
CDS與開放讀碼框ORF的區(qū)別
(1)開放讀碼框是從一個(gè)起始密碼子開始到一個(gè)終止密碼子結(jié)束的一段序列;不是所有讀碼框都能被表達(dá)出蛋白產(chǎn)物,或者能表達(dá)出占有優(yōu)勢(shì)或者能產(chǎn)生生物學(xué)功能的蛋白.
(2) CDS,是編碼一段蛋白產(chǎn)物的序列.
(3) cds必定是一個(gè)orf.但也可能包括很多orf.
(4)反之,每個(gè)orf不一定都是cds.
(5)Open reading frame (ORF) - a reading frame that does not contain a nucleotide triplet which stops translation before formation of a complete polypeptide.
Coding sequence (CDS)- The portion of DNA that codes for transcription of messenger RNA
ORF-----translation,CDS----transcription
translation 是理論上的,而transcription則顯然是事實(shí)存在的.
cDNA為具有與某RNA鏈呈互補(bǔ)的堿基序列的單鏈DNA即complementary DNA之縮寫
,或此DNA鏈與具有與之互補(bǔ)的堿基序列的DNA鏈所形成的DNA雙鏈
EST (Expressed Sequence Tag)表達(dá)序列標(biāo)簽—是從一個(gè)隨機(jī)選擇的cDNA 克隆,進(jìn)行5’端和3’端單一次測(cè)序挑選出來獲得的短的cDNA 部分序列,代表一個(gè)完整基因的一小部分,在數(shù)據(jù)庫中其長度一般從20 到7000bp 不等,平均長度為360 ±120bp .由于cDNA文庫的復(fù)雜性和測(cè)序的隨機(jī)性,有時(shí)多個(gè)EST代表同一基因或基因組,將其歸類形成EST簇(EST clusteF)
mRNA攜帶遺傳信息,在蛋白質(zhì)合成時(shí)充當(dāng)模板的RNA.