1989年年末，任天堂宣布下一代主機(jī)的開發(fā)由自己和索尼共同完成，這一新聞著實(shí)讓日本國(guó)內(nèi)的大小媒體很感興趣。也讓玩家們無(wú)比期待。開發(fā)期間，久多良木健更是一周一次的去往任天堂總部研討開發(fā)事宜，在此期間與任天堂公司內(nèi)的一些軟件開發(fā)人員建立了良好的私人關(guān)系。任天堂情報(bào)開發(fā)部甚至已經(jīng)試做了3款SFC用CD主機(jī)的游戲，一切仿佛都在順利地進(jìn)行著。

1990年1月1日，任天堂與索尼公司正式簽訂合作契約。索尼社長(zhǎng)大賀典雄和任天堂社長(zhǎng)山內(nèi)溥都出席了簽約儀式。在發(fā)表會(huì)中，索尼特意演示了一段侏羅紀(jì)時(shí)代恐龍生態(tài)的DEMO影像。高素質(zhì)的CG表現(xiàn)效果，令業(yè)內(nèi)人士和到場(chǎng)記者贊嘆不已。在這次聯(lián)合發(fā)布會(huì)上，索尼所展示出的強(qiáng)大技術(shù)力令深謀遠(yuǎn)慮的山內(nèi)溥非常震驚。山內(nèi)溥擔(dān)心在之后的合作中任天堂會(huì)完全失去主動(dòng)權(quán)。1991年初，大律師出身的美國(guó)任天堂總裁霍華德?林肯在仔細(xì)研究索尼與任天堂兩社合約的相關(guān)條文之后指出，這份合同中有許多模棱兩可的地方。并且可以讓索尼輕易取得任天堂在家用游戲機(jī)方面的經(jīng)驗(yàn)，進(jìn)而自己獨(dú)立進(jìn)軍游戲產(chǎn)業(yè)。這與山內(nèi)溥的擔(dān)心不謀而合。害怕?lián)碛谐錾布夹g(shù)的索尼將來(lái)會(huì)成為自己的勁敵，任天堂這時(shí)開始起了異心。飛利浦的適時(shí)出場(chǎng)，也讓事件發(fā)生了戲劇性的變化。
1991年6月1日，索尼在芝加哥舉辦的CES電子消費(fèi)展中，正式發(fā)表了SFC擴(kuò)充CD-ROM機(jī)“playstation”。與此同時(shí)，任天堂又與飛利浦舉行了記者招待會(huì)，宣布了兩家將共同開發(fā)SFC用的另一款CD-ROM主機(jī)CD-I。此舉頓時(shí)在在業(yè)界引起軒然大波，索尼被突如其來(lái)的變故搞得陣腳大亂。索尼立即向任天堂發(fā)面求證，而任天堂則表示兩者為同一延長(zhǎng)線上的產(chǎn)品，并沒有違反合約。直到這時(shí)候，索尼才發(fā)現(xiàn)自己被任天堂背叛了。

任天堂的這一行為，使得久多良木健從天堂掉到地獄。索尼也曾考慮停止供應(yīng)SFC的聲音處理芯片作為報(bào)復(fù)，但這個(gè)行為會(huì)讓賠償巨額違約金。當(dāng)時(shí)的索尼根本承擔(dān)不起這筆損失。所以只能任由任天堂背叛，索尼內(nèi)部也將這個(gè)錯(cuò)誤歸咎于久多良木健。此時(shí)的久多良木健也因此遭到相當(dāng)程度的內(nèi)心譴責(zé)，大多人就都認(rèn)為他會(huì)從此一蹶不振。令人沒有想到的是，久多良木健非但沒有引咎辭職，卻還在一次會(huì)議中，直接向索尼當(dāng)時(shí)的社長(zhǎng)大賀典雄大膽諫言。他認(rèn)為索尼應(yīng)該直接進(jìn)入TV游戲市場(chǎng)與任天堂競(jìng)爭(zhēng)。在久多良木健的再三說(shuō)服下，索尼集團(tuán)最終決定自主研發(fā)家用游戲主機(jī)。

雖然任天堂和索尼的恩怨糾葛就此展開，SFC的擴(kuò)充計(jì)劃也舉起不定。但這切都無(wú)法阻止任天堂新一代主機(jī)SFC的熱賣。這臺(tái)擁有兩顆圖形協(xié)處理器的16位家用游戲機(jī)，憑借任天堂豪華的游戲陣容，以及強(qiáng)大的圖像音樂表現(xiàn)力，迅速在日本繼承了FC的市場(chǎng)。
首發(fā)游戲《超級(jí)馬里奧世界》再次起到了重要作用，其銷售數(shù)量幾乎和SFC主機(jī)數(shù)量相當(dāng)。也就是說(shuō)日本的每個(gè)SFC用戶都幾乎都買了這款游戲。全球各大媒體爭(zhēng)相報(bào)道了SFC的發(fā)售盛況，所有的一切只能用氣勢(shì)如虹來(lái)形容。次年,SFC在美國(guó)發(fā)售。由于世嘉的MD在美國(guó)已經(jīng)建立的足夠龐大的群眾基礎(chǔ)，使得SFC在北美一度陷入苦戰(zhàn)。任天堂針對(duì)新一代玩家的口味，對(duì)產(chǎn)品進(jìn)行了非常成功的重新包裝。以“歸來(lái)的馬里奧”為宣傳口號(hào)的廣告鋪天蓋地，神話終于再度重演。《超級(jí)馬里奧世界》使得SFC主機(jī)在北美地區(qū)的銷量迅速趕上了先行發(fā)售兩年多的世嘉MD并且一路高歌猛進(jìn)。這部作品的海外累積銷售超過1500萬(wàn)份。

在此之后，《最終幻想4》的發(fā)售成功的促進(jìn)了SFC的普及。同時(shí)也奠定了最終幻想系列的幾大核心要素。借助SFC豐富多彩的畫面和收縮旋轉(zhuǎn)的功能?！蹲罱K幻想4》大放異彩，也使得史克威爾（SQUARE）公司的實(shí)力和形象得到了大幅提升，更促使其成為日本頂級(jí)游戲制作廠商。之后史克威爾相繼推出了《最終幻想5》和《最終幻想6》讓該系列走向巔峰。融合了各代優(yōu)點(diǎn)的《最終幻想6》，世界觀宏大，故事情節(jié)感人至深，華麗的游戲界面，流暢的操控。這一切讓《最終幻想6》成為了玩家心中最經(jīng)典的一作，直到今天仍然有無(wú)數(shù)玩家追捧。

在SFC周年紀(jì)念日發(fā)售的《塞爾達(dá)傳說(shuō)：眾神三角力》更是受到了全球游戲媒體的廣泛好評(píng)，也成功地使得SFC在1991的圣誕圣誕商戰(zhàn)占盡風(fēng)頭。1992年的《超級(jí)馬里奧賽車》也獲得了空前的反響，遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出了任天堂當(dāng)時(shí)的預(yù)期。在《超級(jí)馬里奧賽車》中，馬里奧系列的各類人物齊齊登場(chǎng)，并且開著卡丁車滿世界轉(zhuǎn)悠，還可以用各種道具擾亂對(duì)手或者給自己加速。這款游戲的趣味性非常好，之后流行的網(wǎng)絡(luò)游戲《跑跑卡丁車》《QQ飛車》都是模仿這個(gè)游戲的設(shè)計(jì)。不僅如此，SFC上的超級(jí)大作層出不窮，《勇者斗惡龍》系列，《皇家騎士團(tuán)》系列，《火焰紋章》系列《洛克人X》系列，《大金剛》系列，《超時(shí)空之輪》等強(qiáng)大的游戲陣容連番轟炸，使得任天堂輕松取得了日本地區(qū)的勝利。

在此期間，著名的街機(jī)游戲開發(fā)商SNK也在1991年推出了家用游戲主機(jī)NEOGEO,但是缺乏第三方支持和昂貴的價(jià)格，讓這臺(tái)游戲機(jī)未能對(duì)SFC產(chǎn)生什么影響。后期世嘉針對(duì)歐美玩家在。MD上推出了大受歡迎的體育游戲和爽快的動(dòng)作游戲，在北美地區(qū)與SFC形成雙雄的局面。跟FC時(shí)代的一家獨(dú)大不同，強(qiáng)大競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手的不斷涌入也讓任天堂四面受敵。除了世嘉和NEC外，家電業(yè)巨頭松下，索尼等也紛紛公布了新一代游戲機(jī)。
任天堂與索尼的合作，在及其蹩腳的關(guān)系中與1992年5月正式破裂。索尼集團(tuán)于1993年5月公布了獨(dú)立開發(fā)下一代游戲主機(jī)“playstation”的計(jì)劃，并在同年正式成立SCE（sony computer entertainment）索尼電腦娛樂公司，由久多良木健擔(dān)任社長(zhǎng)。久多良木健從一開始就知道，PS想要成功必須依賴第三方游戲廠商。因此久多良木健與其他SCE高層，不斷拜訪日本第三方游戲廠商，各公司對(duì)需要投入更多研發(fā)經(jīng)費(fèi)的3D游戲都表示不感興趣，認(rèn)為2D游戲仍然會(huì)是市場(chǎng)的主流。還有一些第三方游戲廠商，并不信任剛剛進(jìn)入游戲產(chǎn)業(yè)的SCE，提出PS銷量至少要達(dá)到300萬(wàn)臺(tái)，才會(huì)為PS開發(fā)游戲。就在幾乎沒有廠商愿意支持這臺(tái)強(qiáng)調(diào)3D能力的游戲主機(jī)時(shí)，游戲業(yè)界投下了一枚重磅炸彈。，讓事情有了180°的大轉(zhuǎn)變。那就是世嘉在街機(jī)上推出了世界上首款格斗游戲《VR快打》。這款3D游戲讓各大游戲廠商大驚失色。卡普空在看到《VR快打》的驚人表現(xiàn)后，立即表示將全力支持索尼的PS。人算不如天算，當(dāng)時(shí)誰(shuí)也沒有想到，久多良木健所極力推崇的3D技術(shù)，卻因?yàn)榱硗庖粋€(gè)競(jìng)爭(zhēng)對(duì)手才能得以推廣。

1993年10月，松下公司推出了其32位家用游戲機(jī)3DO，這臺(tái)拉開次世代帷幕的主機(jī)率先在美國(guó)上市。這臺(tái)主機(jī)的售價(jià)高達(dá)699美元，是SFC和MD價(jià)格的四倍，雖然3DO的性能在當(dāng)時(shí)冠絕群雄，但是與大部分失敗的游戲機(jī)一樣，高昂的費(fèi)用和缺乏第三方廠商的大力支持，讓這臺(tái)代表新時(shí)代開端的主機(jī)迅速退出了歷史舞臺(tái)。

任天堂似乎依舊穩(wěn)坐頭把交椅，同時(shí)發(fā)表了下一代家用游戲主機(jī)N64和后續(xù)掌機(jī)VB的計(jì)劃。山內(nèi)溥在1994年年中的業(yè)績(jī)說(shuō)明會(huì)上，更是充滿自信的貶低對(duì)手，聲稱如果某些家電廠商推出了的CD-ROM的32位主機(jī)銷量能突破百萬(wàn)臺(tái)，他將辭去社長(zhǎng)職務(wù)并且頭朝下走路。其矛頭直指松下3DO和索尼的PS。1994年底松下和索尼兩家的32位次世代游戲主機(jī)相繼發(fā)售。華麗的畫面和精彩的CG讓電子游戲發(fā)生了翻天覆地的變化。世嘉的土星（Saturn）于1994年11月22日率先發(fā)售，在主機(jī)發(fā)售前一個(gè)月，首批的20萬(wàn)臺(tái)就被全部預(yù)訂。首發(fā)當(dāng)日，15萬(wàn)臺(tái)主機(jī)迅速告罄。購(gòu)買土星的玩家多數(shù)是沖著《VR快打》來(lái)的。索尼的PS緊隨其后，于1994年12月3日正式發(fā)售，這臺(tái)幾乎決定了整個(gè)SCE成敗的主機(jī)，連索尼社長(zhǎng)大賀典雄都給予高度關(guān)注。首發(fā)10萬(wàn)臺(tái)的PS主機(jī)與南夢(mèng)宮一同發(fā)售的《山脊賽車》被一搶而空，成功的開始讓整個(gè)SCE歡欣鼓舞。

在第一輪的較量中，土星憑借世嘉在游戲領(lǐng)域的經(jīng)驗(yàn)以及《VR快打》的鼎力護(hù)航，銷量上稍微領(lǐng)先索尼PS。不過這點(diǎn)微弱的優(yōu)勢(shì)根本難不倒久多良木健，他在PS發(fā)售前就已經(jīng)將土星拆機(jī)分析，技術(shù)出身的久多良木健輕易看出了土星內(nèi)部復(fù)雜的結(jié)構(gòu)和高昂的成本，于是他抓住了土星的軟肋，兩年內(nèi)四次降價(jià)。這讓成本相對(duì)較高的土星難以應(yīng)付。1995年5月7日，索尼與世嘉同時(shí)宣布，PS和土星銷量超過100萬(wàn)臺(tái)。兩大32位主機(jī)的競(jìng)爭(zhēng)進(jìn)入了白熱化的階段，這讓山內(nèi)溥顏面掃地。惱羞成怒的山內(nèi)溥因此決定，將正在研發(fā)中的VB推向市場(chǎng)。VB的項(xiàng)目負(fù)責(zé)人橫井軍平向山內(nèi)溥再三強(qiáng)調(diào)了VB當(dāng)前的狀況還不適合投入市場(chǎng)，但這并沒有改變山內(nèi)溥的決定。山內(nèi)溥提出的理由是要用VB狠狠的打擊世嘉土星以及索尼的PS，以及趕上學(xué)生放假的暑期檔。

VB是由一個(gè)頭罩式眼鏡和一個(gè)手柄組成，最大的特點(diǎn)是玩家可以通過頭罩式眼鏡看到立體的游戲畫面，這種立體成像所表現(xiàn)出來(lái)的視覺效果在當(dāng)時(shí)看來(lái)十分震撼。但是當(dāng)時(shí)的技術(shù)還沒有完全成熟，眼罩內(nèi)只能看到單一的紅色。更麻煩的是，這種頭罩式液晶眼鏡在玩家頭部晃動(dòng)的時(shí)候，會(huì)造成圖像錯(cuò)位而且很嚴(yán)重。為了完成山內(nèi)溥的要求，橫井軍平不得不在VB的頭罩式液晶眼睛下加了一個(gè)三角支架，這樣圖像就不會(huì)紊亂錯(cuò)位了，當(dāng)然玩家也不能把頭罩帶著到處跑了。

1995年7月15日，任天堂的VB正式發(fā)售。任天堂的鐵粉這次也有些猶豫了，兩周的時(shí)間里只銷售了14萬(wàn)臺(tái)。VB的滯銷讓零售店難以承受，最后不得不以三折的價(jià)格拋售。屋漏偏逢連夜雨，這時(shí)候有一名權(quán)威眼科專家還指出VB會(huì)對(duì)視力造成嚴(yán)重?fù)p害，這在當(dāng)時(shí)引起了很大反響。最終VB毫無(wú)懸念的失敗了，而VB項(xiàng)目的負(fù)責(zé)人橫井軍平也無(wú)奈辭職。
這讓當(dāng)時(shí)的日本游戲界非常震驚。也讓任天堂的股票大跌10%導(dǎo)致停牌。VB的失敗對(duì)任天堂的家用機(jī)市場(chǎng)影響很大。而山內(nèi)溥這種非理性的市場(chǎng)策略給任天堂帶來(lái)了一個(gè)又一個(gè)麻煩。

任天堂也從此迎來(lái)了它在家用游戲機(jī)市場(chǎng)的十年黑暗。