Varona, L., and Misztal, I. 1999. Prediction of Parental Dominance Combinations for Planned Matings, Methodology, and Simulation Results. J. Dairy Sci. 82(10): 2186–2191. Elsevier. doi:10.3168/jds.S0022-0302(99)75463-9.
優(yōu)勢(shì)信息的最佳使用需要一個(gè)交配系統(tǒng),并為每一組準(zhǔn)父母預(yù)測(cè)具體的組合能力。目前的評(píng)估程序僅為有限的父母提供這樣的預(yù)測(cè)。描述一個(gè)程序,預(yù)測(cè)任何父母的具體組合能力。在這個(gè)過程中,對(duì)于每一組父母及其祖先,加性關(guān)系矩陣被創(chuàng)建為一個(gè)密集矩陣。然后使用該矩陣以稀疏矩陣形式創(chuàng)建父母優(yōu)勢(shì)矩陣,其中矩陣的行對(duì)應(yīng)于已經(jīng)可用的預(yù)測(cè)的所有父母組合。每一個(gè)新的預(yù)測(cè)都需要方程組解的方程組,左邊是父母優(yōu)勢(shì)矩陣。在一個(gè)模擬研究中評(píng)估了占優(yōu)勢(shì)的交配系統(tǒng)的效率。模擬的數(shù)據(jù)文件在所選擇的男性和女性的比例,通過胚胎移植產(chǎn)生的牛的比例以及加性和顯性方差中變化。父本和父母只是基于附加的優(yōu)點(diǎn)而被預(yù)先選定的,但是基于組合的加和優(yōu)勢(shì)優(yōu)勢(shì)來安排具體的交配??紤]到優(yōu)勢(shì)的選擇響應(yīng)從一代添加劑選擇的響應(yīng)從3.8增加到16.6%。當(dāng)加性方差較小時(shí),顯性方差較大,加性選擇強(qiáng)度較低,全同胞比例較大。在交配系統(tǒng)中使用優(yōu)勢(shì)是可行的,并導(dǎo)致對(duì)選擇的額外遺傳響應(yīng)。 (關(guān)鍵詞:優(yōu)勢(shì),遺傳反應(yīng),交配系統(tǒng))
介紹
數(shù)量性狀的遺傳變異可以分為加性和非加性效應(yīng)(5)。在傳統(tǒng)的選擇方案中,加性的選擇被用來改善家畜生產(chǎn),選擇的方法通常是基于BLUP(8)。在目前用于選擇的模型中,非加性變異被忽略,因?yàn)樵谀P椭邪ㄟ@些效應(yīng)的大計(jì)算需求,沒有非加性遺傳變異的證據(jù),以及非加性關(guān)系的低發(fā)生率。
優(yōu)勢(shì)可以在選擇模型中考慮。 Hoeschele和??VanRaden(10)開發(fā)了一個(gè)程序,以相對(duì)較低的成本直接創(chuàng)建優(yōu)勢(shì)關(guān)系矩陣的逆矩陣。 Misztal(12)制定了計(jì)算優(yōu)勢(shì)解決方案的程序,其費(fèi)用低于附加遺傳評(píng)估的兩倍。該過程與方法R(14)一起允許估計(jì)大數(shù)據(jù)集中的優(yōu)勢(shì)變異。隨后的研究估計(jì),在奶牛(13),肉牛(6)和豬(3)的類型和生產(chǎn)性狀的表型變異的4%到12%處存在顯性差異。在模型中包含顯性可以提供對(duì)模型加性效應(yīng)評(píng)估的邊際改善(1,15),并允許通過使用特定組合能力的預(yù)測(cè)來選擇個(gè)體之間的交配(4)。
組合能力的選擇需要預(yù)測(cè)種群中所有可能父母的親本組合。然而,根據(jù)目前的評(píng)估程序,只有與數(shù)據(jù)直接相關(guān)的父母組合是可用的(10,12)。這項(xiàng)研究的第一個(gè)目標(biāo)是開發(fā)一個(gè)程序來預(yù)測(cè)以前計(jì)算的父母組合。
選擇組合能力的增益取決于優(yōu)勢(shì)和其他方差,群體結(jié)構(gòu)和選擇強(qiáng)度。這種收益已經(jīng)用父系模型(4)進(jìn)行了研究,但與動(dòng)物模型無關(guān)。第二個(gè)目標(biāo)是通過用動(dòng)物模型進(jìn)行模擬來評(píng)估遺傳反應(yīng)的潛在增益。