Kuang 1999標記 檢測近交衰退基因

  1. Kuang H, Richardson TE, Carson SD, Bongarten BC. Genetic analysis of inbreeding depression in plus tree 850.55 of Pinus radiata D. Don. II. Genetics of viability genes. Theor. Appl. Genet. 1999;99:140–6.

大多數(shù)針葉類物種表現(xiàn)出嚴重的近交衰退。自交個體通常具有降低的存活力,減少的活力和形態(tài)學缺陷。 輻射松優(yōu)株850.55自交后filled種子的數(shù)量是其異交數(shù)量的48%,自交幼苗的26.1%在早期死亡。研究了172個標記(覆蓋56%的基因組)在輻射松優(yōu)樹850.55的自交后代中的分離。基于標記的分離比,鑒定與近交繁殖對生存力相關的基因(P(0.05)。使用期望/條件最大化(ECM)算法,我們估計生活力基因的位置,優(yōu)勢程度和選擇系數(shù)。發(fā)現(xiàn)了9個估計生活力基因,其中7個是顯性的,一個是部分顯性的(優(yōu)勢度為“0.4”),另一個基因是超顯性的或偽上超顯性的,其中兩個純合子的選擇系數(shù)分別為0.4和0.42。在顯示優(yōu)勢或部分優(yōu)勢的基因中,7個是亞致死的,選擇范圍從0.55到0.79;一個基因(SDPr),負責幼苗死亡在發(fā)芽后的第一個月內,是致命的。


介紹
大多數(shù)針葉樹種,如其他異交種,表現(xiàn)出近交衰退(Williams和Savolainen 1996綜述)。近交衰退可以以許多方式表現(xiàn)。在種子中,樹種可能具有減少的種子產(chǎn)量,種子可以具有較低的發(fā)芽率,并且幼苗可以具有較高的異常百分比,較低的存活率和減少的生長。filled種子的產(chǎn)量降低是其中的最一致和嚴重的結果之一(Bingham和Squillace 1955; Snyder 1968; Sorensen 1971; Sorensen和Miles 1974; Fowler和Park 1983; Gri $ n和Lindgren 1985)。通常認為純合的致死或亞致死等位基因負責在自交(Orr-Ewing 1957; Sarvas 1962; Hagman和Mikkola 1963; Mergen等人1965)時產(chǎn)生空種子,但直接證據(jù)是罕見的(Fowler 1964,1965; Hedrick和Muona 1990)。根據(jù)近親近交衰退對生存力(種子生產(chǎn),在大多數(shù)情況下)的程度,已經(jīng)估計許多針葉樹種的致死當量數(shù)(Williams和Savolainen 1996)。然而許多涉及的基因是未知的。致死當量的數(shù)目是僅當隱性純合子完全致死時所涉及的基因數(shù)目的近似估計。另一方面,許多更多的基因可能正在操作。通過分子標記,可以鑒定完全致死和亞致死等位基因,并且可以研究它們的遺傳性質。在自然選擇后,家系中有害的基因型應該以比Men- delian比例預期的更低的頻率存在。緊密連鎖的分子標記物也應該顯示失真的孟德爾比。標記的分離失調提供了關于連鎖的有害等位基因的位置和遺傳效應的信息。 Hedrick和Muona(1990)使用最大可能方法對自交系中一個同工酶標記(#umorescent esterasase)的分離數(shù)據(jù)鑒定蘇格蘭松中的有害等位基因。最近開發(fā)了更復雜的利用兩個共同顯性標記的分離數(shù)據(jù)的方法。 Cheng et al。 (1996)使用期望/條件最大化(ECM)方法來研究水稻的生存力基因。輻射松(Pinus radiata)已成為其中之一
最經(jīng)濟上重要的樹種在世界上。 Plus樹850.55已被證明是所有輻射松選擇中生長速率最好的。不幸的是,輻射松像大多數(shù)針葉樹一樣,表現(xiàn)出顯著的近親近交衰退(Wilcox 1983; Gri $ n和Lindgren 1985),預計這將表現(xiàn)為輪回選擇繼續(xù)。每個錐體的種子數(shù)在sel“ng plus tree 850.55之后是異交的48%; S中的種子數(shù)量是S的48%(Gri $ n和Lindgren 1985)。在這里提出的研究中,基于隨機擴增多態(tài)性DNA(RAPD)和微衛(wèi)星標記的分離數(shù)據(jù),研究了輻射蟲基因組+樹850.55基因組中的有害等位基因,支配性程度和相應的活力基因的選擇系數(shù)。

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