學(xué)習(xí)小組Day3筆記-洪好納

·Linux應(yīng)用商店conda下載及軟件的安裝與卸載

  1. 進(jìn)入軟件安裝目錄，例：cd biosoft
  2. 下載命令為：wegt+miniconda下載網(wǎng)址【清華大學(xué)鏡像站】https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
  3. 安裝miniconda，命令為：bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh ，然后按指定操作即可
  4. 安裝miniconda結(jié)束后，還需激活，命令為：source ~/.bashrc
  5. 安裝并激活后，需添加鏡像（主網(wǎng)站的副本，中間商意思）。輸入命令為：conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge
    conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda
    conda config --set show_channel_urls yes
    注：有yes和沒有yes的區(qū)別

·使用conda

  1. 查看當(dāng)前服務(wù)器上安裝的所有軟件列表，命令為：conda list
  2. 搜索、下載與卸載軟件
    命令分別為
    conda search fastqc
    conda install fastqc -y
    conda remove fastqc -y
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