3. 分析基因突變與藥物敏感性影響（GDSC）

1. 通過基因檢索

   • Step 1 - 點擊"features"，選擇泛癌或者其他特定癌種，并輸入基因名稱"TP53"
   • Step 2 - 下面會有“TP53_mutant”，點擊進入可見到火山圖"即可觀察該基因突變對藥物敏感性的影響"-

     此時也可以勾選癌癥類型，紅色代表突變后引起耐藥，綠色表示敏感，面積大小代表顯著性差異大小

   • Step 3 - 此時也可以勾選散點圖，并且點擊散點圖的右上角“select drug”還可以選擇特定藥物，也可以勾選特定癌種

     可以看到該藥物作用下基因野生型和突變型的耐藥性差異，并且可以一目了然的看到該藥物作用下對于該基因突變野生型藥物敏感程度在哪種腫瘤中最顯著。

2. 通過細胞系檢索

   • Step 1 - 點擊"cell lines"，可以瀏覽尋找也可輸入細胞系的名稱“201T” - 頁面會有細胞系名稱，COSMIC ID，腫瘤組織，分類等信息
   • Step 2 - 點擊“201T”即可進入該細胞系的頁面，- 可以看到該細胞系對哪些藥物敏感，哪些藥物耐藥
   • Step 3 - 此時點擊“COSMIC ID” - 可以看到該細胞系的基因圖譜以及所有信息

3. 通過細胞系檢索

• Step 1 - 點擊"compounds"，可以瀏覽尋找也可輸入藥物名稱 - 可以看到藥物名稱，靶點基因及通路，Pubchem ID
• Step 2 - 點擊“cisplatin”即可進入該藥物頁面，- 可以看到該藥物的最大最小IC50以及相關細胞數(shù)量，除表格以外，下方有相關數(shù)據的excel表格，可以導出分析。
• Step 3 - 還可以點擊火山圖，顯著性差異默認設置為小于20，可以自己根據P值進行重新設置，兩個圖均可以看到哪些基因突變對該藥物的敏感性有所影響。
• 還可以點擊散點圖，并可以根據右上角的“select features”還可以選擇特定基因突變情況，也可以勾選特定癌種