一.認(rèn)識(shí)R和Rstudio
- R是一種編程語(yǔ)言,也是統(tǒng)計(jì)計(jì)算和繪圖的環(huán)境,它匯集了許多函數(shù),能夠提供強(qiáng)大的功能。
- R語(yǔ)言軟件界面簡(jiǎn)陋,通常不直接使用,而是用圖形界面的Rstudio。
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RStudio是免費(fèi)提供的開(kāi)源集成開(kāi)發(fā)環(huán)境(IDE)。RStudio提供了一個(gè)具有很多功能的環(huán)境,使R更容易使用,是在終端中使用R的絕佳選擇。
俺的Rstudio界面
作圖說(shuō)簡(jiǎn)單也簡(jiǎn)單,只需要知道圖的名字,知道用的什么R包即可自行探索;說(shuō)難也難,別人的代碼套在自己的數(shù)據(jù)上,需要一定的R語(yǔ)言功底和解決報(bào)錯(cuò)的能力?!判乔?/p>
- 這話(huà)說(shuō)的是實(shí)話(huà),所以一個(gè)良好的編程功底才是成為一個(gè)計(jì)算生物學(xué)家的前提,不然永遠(yuǎn)就在實(shí)驗(yàn)生物學(xué)家背后跟著吧!
二.設(shè)置字體大小
某種意義上,這一步很重要,不然像我這種老年兔,看一會(huì)電腦,眼睛就花的不行。

字體設(shè)置
三.R語(yǔ)言基本操作
1.用Rproject管理工作目錄
所謂工作目錄就是默認(rèn)的讀取和儲(chǔ)存位置,也就是說(shuō),R語(yǔ)言只能和一個(gè)文件夾進(jìn)行互動(dòng),這個(gè)文件夾非常重要,做不好就會(huì)導(dǎo)致你的腳本、文件、圖片各種亂跑,找不到。——生信星球
- 養(yǎng)成良好習(xí)慣,從我做起。
正常情況下關(guān)于工作目錄的介紹是:
- 設(shè)置工作目錄:setwd()
- 查看工作目錄:getwd()
2.顯示文件列表
dir()
list.files()
3.加減乘除
sqrt() #開(kāi)根號(hào)
log10(100)#結(jié)果為2
4.賦值
賦值符號(hào)用<-,這是小于號(hào)加上減號(hào),也可以按Alt加上減號(hào)
5.刪除變量
rm(x)
6.列出歷史命令
history()
相當(dāng)于鼠標(biāo)單擊右上角的history標(biāo)簽

image
當(dāng)你雙擊某個(gè)命令,他就會(huì)跳到你的控制臺(tái)大于號(hào)后面了,可以修改后運(yùn)行。
7.清空控制臺(tái)
ctrl+1

控制臺(tái)被清空嘍
