前兩天剛介紹了12大經(jīng)典信號(hào)通路，今天就介紹一下和信號(hào)通路相關(guān)的數(shù)據(jù)庫(kù)：KEGG數(shù)據(jù)，接下來(lái)，我們將對(duì)該數(shù)據(jù)進(jìn)行概述及通路信息檢索。

第一：KEGG的簡(jiǎn)介

KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)包含了16個(gè)子數(shù)據(jù)庫(kù)，涵蓋了信息系統(tǒng)、基因組信息、化學(xué)信息和健康信息。

二、頁(yè)面介紹

?1導(dǎo)航欄

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2?KEGG簡(jiǎn)介

3?子數(shù)據(jù)庫(kù)及鏈接（點(diǎn)擊相應(yīng)子數(shù)據(jù)庫(kù)可以進(jìn)入相應(yīng)鏈接）

4?在線分析工具

二、子數(shù)據(jù)庫(kù)信息搜索（以KEGG?DISEASE為例）

上一期我們介紹了信息通路，也總結(jié)了哪些疾病和哪些通路有關(guān)，這里我們可以借助KEEG數(shù)據(jù)里查詢我們研究的疾病是否和你選擇的通路密切相關(guān)。

點(diǎn)擊KEEG?DISEASE?進(jìn)入該搜索界面，以肺癌為例（打開(kāi)速度有時(shí)有點(diǎn)慢，耐心等待哦··后面也沒(méi)顯示全所有的檢索信息，就先羅列出來(lái)）

點(diǎn)擊左側(cè)Entry(藍(lán)色)，如H00013，我們可以鏈接到詳細(xì)的信息，在新的鏈接中可以看到對(duì)SCLC的description、Category、Brite、Pathway、Gene等相應(yīng)信息。

下一步，我們介紹他的另一個(gè)子數(shù)據(jù)庫(kù)，pathway database，我們可以發(fā)現(xiàn)它包含了5小類，分別是map、ko、ec、rn、<org>。

以PTEN基因?yàn)槔?，去搜索相?yīng)的信號(hào)通路，搜索結(jié)果如下：

點(diǎn)擊相應(yīng)信號(hào)通路圖，可以進(jìn)入map界面，通過(guò)左上角下拉菜單，可以在pathway database的五個(gè)小類進(jìn)行切換。

信號(hào)通路圖的圖解可以借助該頁(yè)面右上腳的“help”，這里還有個(gè)總結(jié)（來(lái)自解螺旋），下面羅列出來(lái)

好了，今天先介紹一些KEEG概要，以及對(duì)他一些子數(shù)據(jù)庫(kù)搜索進(jìn)行概要，未完待續(xù)！