線粒體和葉綠體基因組的組裝、注釋

組裝

GetOrganelle主要用于組裝各種質(zhì)體（葉綠體、線粒體）GetOrganelle github 可以使用二代/三代數(shù)據(jù)
MitoFinder 用于組裝、注釋線粒體基因組 可以使用二代/三代數(shù)據(jù)，或已經(jīng)組裝好的基因組里獲取線粒體的reads.
NOVOPlasty 組裝葉綠體或線粒體 貌似只支持二代數(shù)據(jù)

注釋

geseq 細(xì)胞器基因組注釋工具
chloe 細(xì)胞器基因組注釋工具

可視化

Chloroplot 細(xì)胞器基因組可視化工具
IRscope 葉綠體基因組連接位點(diǎn)和邊界區(qū)域基因可視化工具

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