0基礎(chǔ)看懂轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果及后續(xù)數(shù)據(jù)應(yīng)用

人非生而知之者,無(wú)論是生活中還是科研中都會(huì)遇到各種陌生事物和難題,比如這種:

或者是這樣的:

此時(shí)你的心情可能是這樣的:

做科研的時(shí)候碰到了這種難題,又沒有系統(tǒng)指導(dǎo)的話,很可能掉進(jìn)坑里:

或者反復(fù)的犯同一個(gè)錯(cuò)誤:

有過類似經(jīng)歷的同學(xué),在第一次拿到轉(zhuǎn)錄組厚厚的三四十頁(yè)結(jié)題報(bào)告和幾百兆的結(jié)果文件的時(shí)候,一定會(huì)想:這怎么下手?!如果再配個(gè)說明書該多好?。?/p>

“說明書”應(yīng)該具備的條件

一份合格的“說明書”應(yīng)該能夠讓0基礎(chǔ)的同學(xué)看懂龐雜的數(shù)據(jù)結(jié)果,知道結(jié)果背后的生物學(xué)意義,解決“是什么”的問題。

此外還應(yīng)該為后續(xù)的數(shù)據(jù)應(yīng)用提供常用的分析方法,解決“怎么做”的問題。

這就是“說明書”!

主流測(cè)序公司在交付轉(zhuǎn)錄組結(jié)果時(shí)會(huì)分成“結(jié)題報(bào)告”和“結(jié)果文件”兩部分。其中結(jié)題報(bào)告(通常是一份幾十頁(yè)的PDF文件或者一個(gè)網(wǎng)頁(yè)版的文件),概述了實(shí)驗(yàn)的分析流程以及每部分的關(guān)鍵結(jié)果:

而結(jié)果文件一般包含了10個(gè)左右的文件夾,放置了各部分分析內(nèi)容的所有結(jié)果。

“說明書” part I

組學(xué)大講堂(高評(píng)價(jià)生信教程制作團(tuán)隊(duì),學(xué)員已超1萬(wàn)人),基于主流測(cè)序公司交付的轉(zhuǎn)錄組標(biāo)準(zhǔn)分析結(jié)果進(jìn)行了全面的解讀,制作了一份視頻教程《轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的解讀》,解決轉(zhuǎn)錄組結(jié)果“是什么”的問題??赐杲坛叹湍軌蚯宄擂D(zhuǎn)錄組分析的流程、原理,以及結(jié)果背后的生物學(xué)意義,為后續(xù)的數(shù)據(jù)挖掘打下堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)?。ǐ@取方法見下文)

“說明書” part II

針對(duì)“怎么做”的問題,我們根據(jù)上千個(gè)項(xiàng)目經(jīng)驗(yàn),總結(jié)了7個(gè)最常用的后續(xù)個(gè)性化挖掘方法,制作了《轉(zhuǎn)錄組標(biāo)準(zhǔn)分析后的數(shù)據(jù)挖掘》,講述的方法大部分可在Windows下操作,無(wú)需linux或者計(jì)算機(jī)語(yǔ)言的基礎(chǔ)。

同學(xué)們學(xué)習(xí)之后可以自主進(jìn)行簡(jiǎn)單的個(gè)性化分析,提高數(shù)據(jù)處理速度,增加文章撰寫效率。

“說明書” part III

當(dāng)然有些同學(xué),已經(jīng)不滿足于基礎(chǔ)的看懂,簡(jiǎn)單的分析,希望獲取一些轉(zhuǎn)錄組分析的高級(jí)技能,我們也給這類同學(xué)準(zhǔn)備了《WGCNA-加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析》的課程。

WGCNA(加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析)可是說是一種對(duì)基因表達(dá)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析的高級(jí)方法,是利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)沖擊高分文章的有效手段。使用基因表達(dá)數(shù)據(jù),構(gòu)建出加權(quán)的基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò),從而挖掘協(xié)同表達(dá)的基因模塊,探索基因模塊與性狀之間的關(guān)系。

“說明書”獲取方法

獲取過程如有疑問可以加微信“izxl1988”進(jìn)行咨詢。

part I:

《有參轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的解讀》電腦端可打開鏈接:

https://study.163.com/course/introduction/1004723037.htm?share=1&shareId=1031484705

無(wú)參轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果的解讀》電腦端可打開鏈接:

https://study.163.com/course/introduction/1005207017.htm?share=1&shareId=1031484705

part II:

《轉(zhuǎn)錄組標(biāo)準(zhǔn)分析后的數(shù)據(jù)挖掘技巧》電腦端可打開鏈接:

https://study.163.com/course/introduction/1005084024.htm?share=1&shareId=1031484705

part III:

《WGCNA-加權(quán)基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析》電腦端可打開鏈接:

https://study.163.com/course/introduction/1005023004.htm?share=1&shareId=1031484705

獲取課程后,可以在電腦端登錄網(wǎng)易云課堂(https://study.163.com/),或者下載“網(wǎng)易云課堂”app在手機(jī)上進(jìn)行觀看。

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