在進行背景校正的時候，出現(xiàn)報錯

y <- backgroundCorrect(x, method="normexp")
Error in (function (classes, fdef, mtable)  : 
  unable to find an inherited method for function ‘backgroundCorrect’ for signature ‘"EListRaw"’

查找到徐洲更的解決報錯方案
「Debug R」報錯"unable to find an inherited method for function"是如何產生的

想著函數(shù)出錯的原因：1、未加載相應的包
2、包中函數(shù)互相沖突
3、其中一個包的函數(shù)屏蔽了另外的包中的函數(shù)

然后搜索了一下在我的R中存在兩個包有“backgroundCorrect”函數(shù)

image.png

之后看到小潔的文章中說使用的是limma包，而解螺旋老師給的oligo函數(shù)是處理昂飛芯片的，于是使用limma包中的函數(shù)

y <- limma::backgroundCorrect(x, method="normexp")

出現(xiàn)了小潔老師文章中的數(shù)據(jù)，算是解決了一個問題。
小潔老師處理安捷倫芯片原始數(shù)據(jù)文章鏈接
aglient芯片原始數(shù)據(jù)處理