2024-06-07 功能更新
- mg2c_2.1版本增加了中文版(http://mg2c.iask.in/mg2c_v2.1/index_cn.html)，中文版與英文版功能完全相同。
mg2c_v2.1 中文版界面
2024-06-05功能更新
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scale欄功能更新
(1) decimal place設(shè)置的是刻度尺上顯示的有效數(shù)字，此次糾正了設(shè)置有效數(shù)字后，但無法正確顯示有效數(shù)字位數(shù)的問題。
v2.1英文版 -- scale欄v2.1中文版 -- 刻度尺欄
更新之前，如果decimal place設(shè)為2，顯示效果如下：
數(shù)據(jù)更新之前
更新之后，顯示效果如下：
數(shù)據(jù)更新之后的效果
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gene id 欄功能更新
(2) 中 gene_display_type參數(shù)增加了選項(xiàng)6，設(shè)置后，染色體上除了基因線不再顯示其他信息。（為了顯示高密度圖譜）
v2.1英文版 -- geneid欄
v2.1中文版 -- 基因ID欄 在畫遺傳圖譜時(shí)。如果多個(gè)分子標(biāo)記的起始位置完全相同，會(huì)出現(xiàn)geneid丟失，可對(duì)geneid位置進(jìn)行微調(diào)即可解決該問題。
例1：輸入1數(shù)據(jù)
輸入1：
n001 0.00 0.00 LG20
n002 0.36 0.36 LG20 red
n003 0.36 0.36 LG20
n004 0.36 0.36 LG20
n005 0.72 0.72 LG20
n006 0.72 0.72 LG20
n007 0.72 0.72 LG20
n008 0.72 0.72 LG20
n009 1.44 1.44 LG20
輸入2：
LG20 1.5
畫遺傳圖譜時(shí)，需對(duì)參數(shù)做如下調(diào)整：
只保留了相同位置的最后一個(gè)基因（分子標(biāo)記）
將輸入1中數(shù)據(jù)做如下調(diào)整后，就能畫出完整的圖譜。
對(duì)輸入1中的位置信息進(jìn)行微調(diào)：
n001 0.00 0.00 LG20
n002 0.36 0.36 LG20 red
n003 0.3601 0.3601 LG20
n004 0.3602 0.3602 LG20
n005 0.72 0.72 LG20
n006 0.7201 0.7201 LG20
n007 0.7202 0.7202 LG20
n008 0.7203 0.7203 LG20
n009 1.44 1.44 LG20
例2：更改基因ID的顯示方式，有1到6可選。其中6是新加的類似于高密度圖譜，只顯示位置。
這里使用網(wǎng)頁自帶的數(shù)據(jù)。
當(dāng)gene_display_type=1時(shí)，圖譜顯示效果如下：
當(dāng)gene_display_type=2時(shí)，圖譜顯示效果如下：
當(dāng)gene_display_type=3時(shí)，圖譜顯示效果如下：
當(dāng)gene_display_type=4時(shí)，圖譜顯示效果如下：
當(dāng)gene_display_type=5時(shí)，圖譜顯示效果如下：
當(dāng)gene_display_type=6時(shí)，圖譜顯示效果如下：
工具引用信息如下：
引用1: Jiangtao Chao#, Zhiyuan Li#, Yuhe Sun, Oluwaseun Olayemi Aluko, Xinru Wu, Qian Wang and Guanshan Liu.(2021). MG2C: a user-friendly online tool for drawing genetic maps. Molecular Horticulture,1:16.
引用2：MapGene2Chrom基于Perl和SVG語言繪制基因物理圖譜. 晁江濤, 孔英珍, 王倩, 孫玉合, 龔達(dá)平, 呂婧, 劉貫山. 遺傳, 2015, 35(1): 91-97.
Chao Jiangtao, Kong, Yingzhen, Wang Qian, Sun Yuhe, Gong Daping, Lv Jing, Liu Guanshan*. (2015). Mapgene2chrom, a tool to draw gene physical map based on perl and svg languages. Hereditas, 37(1):91-97
