簡(jiǎn)捷 | BLAST Zone 從數(shù)據(jù)庫(kù)中直接提取序列!

寫(xiě)在前面

今天周末,人在貴陽(yáng)。BLAST Zone 這個(gè)功能,我太喜歡了。寫(xiě)出來(lái)之后,基本我天天用。主要原因還是簡(jiǎn)單,他確實(shí)比以前各個(gè) BLAST GUI Wrapper 功能更為方便。越是方便,用著就越是開(kāi)始;用的越多,自然也會(huì)發(fā)現(xiàn)功能的一些值得改進(jìn)的地方。

問(wèn)題由來(lái)

常常,我們會(huì)有一個(gè)序列,希望比對(duì)到基因組上,于是有下面的樣式。



于是會(huì)出現(xiàn)一個(gè)場(chǎng)景,我們比對(duì)得到結(jié)果,大體如下,



現(xiàn)在拿到了 ID ,可能怎么拿到對(duì)應(yīng)的序列。當(dāng)然,我們可以拿著這些 ID 用 TBtools 的 Fasta Extract 各功能。這些功能需要我們?cè)O(shè)置一個(gè)待提取的庫(kù)蛋白序列。

略顯麻煩,另外當(dāng)然是庫(kù)文件序列是哪個(gè)?或許這個(gè)時(shí)候已經(jīng)搞不清楚。于是,最好的解法就是直接從 BLAST Zone 的 數(shù)據(jù)庫(kù) 中提取我們想要的序列。

BLAST Zone 支持序列直接提取

事實(shí)上,從設(shè)計(jì) BLAST Zone 開(kāi)始,我就已經(jīng)寫(xiě)了相關(guān)功能,但一直沒(méi)有開(kāi)放,因?yàn)椴恢廊绾卧O(shè)計(jì)更為合適。想來(lái)想去就還是放下。但是問(wèn)題就是,這段時(shí)間,BLAST Zone 用著總有不爽的時(shí)候。索性,今天就給他增強(qiáng)一下。不求優(yōu)雅,但求實(shí)用


于是會(huì)看到彈窗,直接在其中操作即可

完美,以后用起來(lái)就方便多了....

寫(xiě)在最后

不求優(yōu)雅,但求實(shí)用。

最后編輯于
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