Histcite快速了解一個(gè)領(lǐng)域

帕累托二八定律

百分之八十的價(jià)值來(lái)自于百分之二十的因子,其余的百分之二十的價(jià)值則來(lái)自于百分之八十的因子

所以,書(shū)讀經(jīng)典,要事第一,任何事情先找方法就是提高效率,可以更快捷地進(jìn)行工作的關(guān)鍵

話不多說(shuō),本篇文章主要介紹一下最近才學(xué)會(huì)的一個(gè)高效檢索文獻(xiàn)的工具----Histcite,可以用于迅速鎖定一個(gè)領(lǐng)域內(nèi)的高質(zhì)量文獻(xiàn)和開(kāi)山鼻祖,大大減少文獻(xiàn)篩選的功夫。

背景介紹

我通常檢索文獻(xiàn)的方法是在pubmed或者WOS中直接輸入關(guān)鍵詞,按照被引頻次由高到低進(jìn)行排列,然后瀏覽每一篇文獻(xiàn)的摘要,逐步找出合適的文獻(xiàn)。但是這樣一方面往往信息量非常大,有的關(guān)鍵詞會(huì)檢索出上萬(wàn)篇論文,高被引文獻(xiàn)也很多,往往沒(méi)有時(shí)間和精力一篇一篇閱讀下去;另一方面,有的文獻(xiàn)雖然引用頻次高,但是其實(shí)跟你想研究的領(lǐng)域沒(méi)有太大的關(guān)系,主要是被其他領(lǐng)域所引用。這時(shí)候,就會(huì)低效率地浪費(fèi)不少時(shí)間。無(wú)意間發(fā)現(xiàn)Hisccite(History of Cite)軟件,可以分析WOS核心數(shù)據(jù)集中的文獻(xiàn),迅速找出自己研究領(lǐng)域內(nèi)使用頻次最高的質(zhì)量最好的文獻(xiàn),覺(jué)得非常有用。Histcite 是由SCI的發(fā)明人加菲爾德開(kāi)發(fā),可用圖示的方式展示某一領(lǐng)域不同文獻(xiàn)之間的關(guān)系,根據(jù)在所參與分析的文獻(xiàn)中引用于被引用的頻次,判斷文章在專業(yè)領(lǐng)域內(nèi)的地位。然后自己選擇出自己需要的高分文獻(xiàn),導(dǎo)出并導(dǎo)入Endnote中進(jìn)行管理。

分析流程

比如我檢索的關(guān)鍵詞是GWAS。

  1. 首先打開(kāi)WOS數(shù)據(jù)庫(kù),檢索欄選擇Web of science核心合集。輸入檢索關(guān)鍵詞:GWAS,進(jìn)行research。
    ![WK8KHN45FO@)]V8Y8WJDN9C.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-067b2bf468a5f9f9.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
    可勾選左側(cè)進(jìn)行檢索結(jié)果精煉。我選擇research area里面的GENETIC HEREDITY進(jìn)行Refine。共檢索出2535條結(jié)果。
    %SOLAKK5PDC}@K0A99I9W7G.png
  2. 導(dǎo)出這2535條結(jié)果:選擇Save to Other File Formats.


    0EJ82`6VCP%R)4F@(D9OW99.png

    Number of records:填寫(xiě)1-500 (隨后依次填寫(xiě)501-1000,1001-1500,1501-2000,2001-2500,2501-2535導(dǎo)出全部記錄。不能多填,因?yàn)橐淮沃荒軐?dǎo)出500條記錄)
    Records Content:Full Record and Cited References
    Fill Format:Plain Text
    然后點(diǎn)擊send


    R))HZXKIF18_ODAH4E%VYIA.png
    將文件(savedrecs)保存至相應(yīng)的文件夾下即可。
  3. 在C盤(pán)中建立文件夾:fakepath。將剛才保存的導(dǎo)出文獻(xiàn)數(shù)據(jù)復(fù)制到此文件夾里。因?yàn)檫@好像是Histcite的默認(rèn)讀取路徑,其他的路徑貌似不能夠?qū)敕治?,在我的電腦上是這樣。
  4. 啟動(dòng)Histcite軟件,彈出IE瀏覽器頁(yè)面
    OUOXZJGQW6P~0)WQXBLQOIY.png

    點(diǎn)擊左上角的File-----瀏覽------在C:\fakepath\下導(dǎo)入文件(如果有多個(gè)文件,依次導(dǎo)入即可)----Add File
    ![Y(DINLE8`72IIRIR_JP}C]N.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-0fd08bb32285d835.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
    最終導(dǎo)入完2535條結(jié)果,顯示界面如下:
    ![}5N4$TF5RK37EJ]BI%39RBI.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-a164e9f5f56c870d.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
    對(duì)參數(shù)的理解詳見(jiàn)參數(shù)介紹。
  5. 點(diǎn)擊工具欄上的Tools, 選擇Graph Maker,彈出作圖界面


    YCM8B$8{HWK(`N}A73(CTV0.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-2ec4bb2195cce8e4.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240) 檢查基本參數(shù)符合要求后,點(diǎn)擊Make Graph. ![6JU3601AV`VYTB(()WS0YBS.png

    此即為文獻(xiàn)引用圖??煞治鲆?jiàn)到,所見(jiàn)所領(lǐng)域內(nèi)的文獻(xiàn)從2007年開(kāi)始,2007年的應(yīng)該是此領(lǐng)域內(nèi)的比較是早的文獻(xiàn),2010年的是文獻(xiàn)高發(fā)的年份。2010年,2011年都有引用頻次很高的文獻(xiàn),這些文獻(xiàn)可能是所研究領(lǐng)域內(nèi)的重要文獻(xiàn)。作圖界面并不復(fù)雜,關(guān)鍵選擇是參與做圖的文獻(xiàn)數(shù)量,其余參數(shù)都是調(diào)整圖片中方塊、線條和字體的大小。這里選擇的是 LCS 排名前 30 的文獻(xiàn)。如果對(duì)圖中某篇文獻(xiàn)感興趣,可以直接點(diǎn)擊它,軟件會(huì)在一個(gè)新窗口中打開(kāi)該文獻(xiàn)的詳細(xì)信息,我們可以預(yù)覽一下論文的標(biāo)題和摘要
    基本軟件操作流程就是這樣,下面詳細(xì)解讀一下各個(gè)參數(shù)的意義及進(jìn)階功能。

參數(shù)介紹

初始界面

![}5N4$TF5RK37EJ]BI%39RBI.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-a164e9f5f56c870d.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
有四個(gè)重要參數(shù)需要我們理解:**LCS,GCS,LCR,GCR **

  • LCS:是local citation score的簡(jiǎn)寫(xiě),即本地引用次數(shù)。它表示這篇文章在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中被引用的次數(shù)。
  • GCS:是global citation score,即引用次數(shù),它表示這篇文章被整個(gè)WOS數(shù)據(jù)庫(kù)中所有文獻(xiàn)引用的次數(shù),也就是你咋web of science網(wǎng)站上看到的引用次數(shù)。
  • LCR:是local cited references ,本地參考文獻(xiàn)數(shù),它表示這篇文獻(xiàn)的參考文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的數(shù)量,即這篇文獻(xiàn)引用別人的情況。如果一篇文章的 LCR 值高,意味著它引用了大量的你限定領(lǐng)域內(nèi)文獻(xiàn),極有可能是綜述文章。
  • CR:是cited references,即文章引用的參考文獻(xiàn)數(shù)量。如果某篇文獻(xiàn)引用了50篇參考文獻(xiàn),則CR為50。這個(gè)數(shù)據(jù)通常能幫我們初步判斷一下某篇文獻(xiàn)是一般論文還是綜述。
    一篇文章GCS很高,說(shuō)明被全球科學(xué)家關(guān)注較多。但是如果一篇GCS很高,而LCS很小,說(shuō)明這種關(guān)注主要來(lái)自與你不是同一領(lǐng)域的科學(xué)家。此時(shí),這篇文獻(xiàn)對(duì)你的參考意義可能不大。
    LCR與CR對(duì)應(yīng)是local cited references,是指某篇文獻(xiàn)引用的所有文獻(xiàn)中,有多少篇文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)庫(kù)中。
    LCS可以快速定位一個(gè)領(lǐng)域的經(jīng)典文獻(xiàn), LCR可以快速找出最新的文獻(xiàn)中哪些是和自己研究方向最相關(guān)的文章。
    進(jìn)行作圖的時(shí)候,通常就是選擇LCS進(jìn)行
補(bǔ)充遺漏的重要文獻(xiàn)

![X2W{(U79Z[QZMLQ]SI9I7E.png
點(diǎn)擊上方Cited references,此處表示的是所有你導(dǎo)入文獻(xiàn)的引用文獻(xiàn)

6T_CIWYWGF5XPM%CR(GXTSJ.png

前面帶有綠色的+號(hào),說(shuō)明這篇文獻(xiàn)不在你當(dāng)前導(dǎo)入的文獻(xiàn)中。Recs是一個(gè)非常重要的參數(shù),它表示這篇文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中被引頻次,通過(guò) Recs 排序,我們很快就可以定位重要的被遺漏的文獻(xiàn)。所以我們很有必要把重要的遺漏文獻(xiàn)添加進(jìn)入進(jìn)行分析。添加的方法如下:

  • 復(fù)制遺漏文獻(xiàn)的DOI,在WOS中檢索出相應(yīng)的文章題目
  • 點(diǎn)擊綠色的+號(hào),把文章題目復(fù)制進(jìn)入Title位置,點(diǎn)擊apply changes,然后close對(duì)話框即可。
    ![LP1$U]86{}5NXOA74BSU6S2.png](http://upload-images.jianshu.io/upload_images/1782692-850d1f688c5ec9f5.png?imageMogr2/auto-orient/strip%7CimageView2/2/w/1240)
    看看是不是已經(jīng)有了變化?綠色箭頭不見(jiàn)了,上方出現(xiàn)紅色的update lists,表明這篇文獻(xiàn)已經(jīng)被添加進(jìn)入目前分析的文獻(xiàn)中。依次類推,為了更全面找到基因遺傳性領(lǐng)域內(nèi)GWAS的重要文獻(xiàn),我把排列位置在前20位的遺漏文獻(xiàn)文獻(xiàn)都手動(dòng)添加進(jìn)去。
    P$WVVSBLVTK@P002LDOK43N.png

    添加好文獻(xiàn)之后,再次進(jìn)行作圖分析,這時(shí)候,可以看到圖已經(jīng)發(fā)生了變化
EPQ6S~1_IVPS9N5DI7MX8O4.png
重要文獻(xiàn)導(dǎo)入endnote進(jìn)行管理
  • 對(duì)于你感興趣的文獻(xiàn)(我感興趣的是按照LCS從高到低進(jìn)行排列),點(diǎn)擊Tools----Make & Tag,select records with (我選擇是1-50),select records only, 點(diǎn)擊Mark即勾選完成


    7%$T90QGFI2EJ$L5U%SSAA3.png

    點(diǎn)擊上方的Makers,即精煉出我所勾選的50篇重要文獻(xiàn)

  • 點(diǎn)擊File----Export----Records----save到相應(yīng)的文件夾,后綴改為.txt
  • 新建一個(gè)endnote文件,將導(dǎo)出的.txt文件導(dǎo)入,即形成endnote文獻(xiàn)集,通過(guò)find full text功能批量下載全文,進(jìn)一步閱讀瀏覽。


    ~I){((3B(PCULTXSETX%KZU.png

注意事項(xiàng)

  1. Histcite軟件下載 (http://science.thomsonreuters.com/scientific/m/HistCiteInstaller.msi
  2. 如果剛開(kāi)始向HistCite內(nèi)導(dǎo)入文獻(xiàn)出問(wèn)題的話,需要把savedrecs文件中開(kāi)頭的Web of Science改為Web of Knowledge,我的就是這樣解決的。

用了幾次HistCite,感覺(jué)對(duì)快速了解一個(gè)領(lǐng)域還是非常有用的。當(dāng)然功能還在繼續(xù)摸索中,希望可以不斷找到提高做事情效率的方法,能夠更高效地做好事情。

最后編輯于
?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時(shí)請(qǐng)結(jié)合常識(shí)與多方信息審慎甄別。
平臺(tái)聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn),簡(jiǎn)書(shū)系信息發(fā)布平臺(tái),僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

友情鏈接更多精彩內(nèi)容