1. 群體遺傳分化的度量

（1）F-統(tǒng)計量

現(xiàn)實植物自然群體并非是理想群體，如果僅考慮單基因座上一對等位基因，對于由若干個地方群體組成的生物大群體，各層次現(xiàn)實群體中基因型頻率期望值偏差一般用Fis、Fif、Fst三個參數(shù)來度量，統(tǒng)稱為F-統(tǒng)計量。
FIS,是Hi相對于Hs減少量的比值，也就是地方群體平均近交系數(shù)。

Fst，是Hs相對于Ht減少量的比值，可理解為有親緣關(guān)系地方群體間的平均近交系數(shù)。

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Wright（1978）建議，實際研究中Fst為0 ~ 0.05，群體間遺傳分化很小，可不考慮群體間遺傳分化；Fst為0.05 ~ 0.15，群體間存在中等程度遺傳分化；Fst為0.15 ~ 0.25，群體間遺傳分化較大；Fst值在0.25以上，群體間有很大遺傳分化。

（2）Nei's Gst

F-統(tǒng)計量是針對一對等位基因提出的，如果基因座上存在復(fù)等位基因時，Nei（1973）定義了不用同源配子結(jié)合的相關(guān)性概念的基因差異分化系數(shù)（gene differentiation coefficient，Gst）。基因差異分化系數(shù)不必考慮地方群體形成歷史、遷移方式、群體中等位基因數(shù)目和基因型頻率，也不必考慮群體內(nèi)是否存在選擇，只需將整個群體中雜合體頻率分解為地方群體間變異和地方群體內(nèi)變異。所有的固定指數(shù)均可以由被調(diào)查的群體中雜合體頻率觀察值和期望值來定義。

（3）等位基因頻率方差

2.遺傳距離

量化群體間遺傳分化程度的另一個參數(shù)是遺傳距離（genetic distance），它常用群體中等位基因頻率的函數(shù)來度量。最理想的遺傳距離度量方法使遺傳距離取值范圍為[0,1]。0表示兩個個體或群體中所有遺傳標(biāo)記都存在，1表示在兩個個體或群體中沒有共同的遺傳標(biāo)記。
遺傳距離應(yīng)該是一個進化度量值，與進化趨異（evolutionary divergence）相關(guān)。進化上，兩組個體分化越大，其遺傳距離值就越大。

（1） Nei's Genetic Distance

假定X和Y是生物兩個不同地方群體（假定地方群體為理想群體），xi、yi分別表示X群體和Y群體特定座位上第i個等位基因頻率，那么：

• 隨機從X群體中抽取一對等位基因是同一（identical）的概率為

• 隨機從Y群體中抽取一對等位基因是同一的概率為

• 分別從X和Y群體中各抽取一個等位基因是同一的概率為

如果m為檢測到的基因座數(shù)，xij、yij分別表示X群體和Y群體中第j個座位上第i個等位基因頻率，rj表示第j個座位上等位基因數(shù)。Jx、Jy、Jxy分別為上述三種概率的算數(shù)平均值，那么

• 隨機從X群體中抽取一對基因組間的不同等位基因的比例為

• 隨機從Y群體中抽取一對基因組間的不同等位基因的比例為
• 分別從X和Y群體中各抽取一個基因組間的不同等位基因的比例為
  
  Nei等證明，Dx、Dy分別表示X、Y群體中隨機抽取基因組間的密碼子差值的最小估計，而Dxy表示來自X、Y群體的兩個基因組間密碼子差值的最小估計，于是Nei's最小遺傳距離的計算式為
  
  Nei's最小遺傳距離是由群體中等位基因頻率直接確定群體間遺傳距離，但各D值表示的是不同來源的基因組間不相同等位基因的比例，這種變異是不可加的。
  為克服這一缺點，將Dm進行標(biāo)準(zhǔn)化，稱為Nei's標(biāo)準(zhǔn)遺傳距離

2. 植物群體間遷移

遷移（migration），是指具有某一地方群體中部分個體或配子，因某種原因傳播至另一地方群體，并雜交定居。如果遷入和遷出群體的遺傳結(jié)構(gòu)不同，將改變遷入地方群體中等位基因頻率，這種影響稱為遷移壓（migration pressure）。
遷移稱為地方群體遺傳變異大來源。
遺傳漂移和自然選擇是群體間差異增加，而遷移的遺傳效應(yīng)正好相反。等位基因橫跨群體間障礙而慢慢擴散，造成遷入群體中等位基因頻率逐漸改變，增加群體間遺傳相似性。這種群體間基因流動，稱為基因流（gene flow）。
群體間遷移的遺傳效應(yīng)主要取決于群體遺傳結(jié)構(gòu)、遷移率、群體分布結(jié)構(gòu)。
植物群體分布結(jié)構(gòu)：

（1） 陸島模型

（2） 島嶼模型

（3） 距離隔離模型

3. 植物基因流

植物基因流，是借助花粉、種子、孢子、營養(yǎng)體等遺傳物質(zhì)攜帶者的遷移或運動來實現(xiàn)的。其中，種子擴散和花粉傳播是植物基因流的最主要方式。植物基因流強弱不僅影響植物群體遺傳變異水平和有效群體大小，而且也會造成群體遺傳結(jié)構(gòu)的重新分配。
研究植物基因流，很大程度上是度量配子（主要是花粉）和種子在群體內(nèi)和群體間的遷移方式和機制。
植物基因流是研究植物群體動態(tài)和進化的一個中心問題，在植物群體片段化活力分析、轉(zhuǎn)基因植物安全性分析、入侵植物的控制等方面具有重要意義。