Cox PH假設(shè)檢驗(yàn)及解決方法

Cox模型的基本假設(shè)

Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型的前提條件是:在某因素下,個(gè)體的風(fēng)險(xiǎn)比例在不同時(shí)間點(diǎn)都是定值。

Cox PH假設(shè)檢驗(yàn)

一般我們使用Schoenfeld殘差來(lái)檢驗(yàn)比例風(fēng)險(xiǎn)假設(shè)(還可以簡(jiǎn)單的通過(guò)生存曲線是否交叉來(lái)粗略判斷下),如果數(shù)據(jù)滿足Cox回歸模型,那么Schoenfeld殘差和生存時(shí)間的秩次之間無(wú)明顯的相關(guān)性,也就是說(shuō)Schoenfeld殘差與生存時(shí)間無(wú)明顯的一致變化趨勢(shì),這里通過(guò)survival包的cox.zph()函數(shù)即可判斷。

library("survival")

library("survminer")

fit <- coxph(Surv(time, status) ~ age + sex, data =? data.set)

test.ph <- cox.zph(fit)

從檢驗(yàn)結(jié)果test.ph中協(xié)變量的P值可進(jìn)行判斷,這里的原假設(shè)為滿足Cox PH假設(shè),因此,若P<0.05,則拒絕原假設(shè),即不滿足Cox PH假設(shè)。

此外我們還可以通過(guò)Schoenfeld殘差與時(shí)間的關(guān)系圖來(lái)診斷模型是否滿足前提,理論上如果滿足的話,Schoenfeld殘差應(yīng)該與時(shí)間無(wú)明顯的趨勢(shì),使用ggcoxzph函數(shù),即ggcoxzph(test.ph)。

解決方法

若不滿足Cox PH假設(shè),可以采用如下方法進(jìn)行解決:

Adding covariate*time interaction(增加協(xié)變量與時(shí)間的交互關(guān)系)

Stratification(分層)

?著作權(quán)歸作者所有,轉(zhuǎn)載或內(nèi)容合作請(qǐng)聯(lián)系作者
【社區(qū)內(nèi)容提示】社區(qū)部分內(nèi)容疑似由AI輔助生成,瀏覽時(shí)請(qǐng)結(jié)合常識(shí)與多方信息審慎甄別。
平臺(tái)聲明:文章內(nèi)容(如有圖片或視頻亦包括在內(nèi))由作者上傳并發(fā)布,文章內(nèi)容僅代表作者本人觀點(diǎn),簡(jiǎn)書系信息發(fā)布平臺(tái),僅提供信息存儲(chǔ)服務(wù)。

相關(guān)閱讀更多精彩內(nèi)容

  • 作者:白介素2 相關(guān)閱讀:R語(yǔ)言生存分析04-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型診斷R語(yǔ)言生存分析03-Cox比例風(fēng)險(xiǎn)模型R語(yǔ)言生...
    醫(yī)科研閱讀 13,892評(píng)論 0 20
  • 本節(jié)主要包括: 在這里先給大家普及一個(gè)單詞 aftermath 創(chuàng)傷!真的是,,,學(xué)完實(shí)變函數(shù)心靈受到了極大的創(chuàng)傷...
    Vector_Wan閱讀 5,048評(píng)論 1 4
  • 周末和閨蜜吃飯,聊天,逛街,真真是好久沒(méi)有做過(guò)的事情了。因?yàn)槊總€(gè)人都在忙,忙于生計(jì),忙于生活,忙于不知道忙的什么!...
    幽幽白書0閱讀 464評(píng)論 0 3
  • 今日打卡任務(wù): 1、解讀一份咱們組的組員報(bào)告,并生成和TA的關(guān)系解讀 2、歸納一下溝通的時(shí)候需要注意什么 剛才看了...
    萌萌denny閱讀 299評(píng)論 0 1
  • 作為一個(gè)女孩,從小聽到的最多的評(píng)論就是長(zhǎng)大后你會(huì)是別人家的人。媽媽也說(shuō)這個(gè)家只是你的一個(gè)暫居地。更何況為了生計(jì),...
    萌黃閱讀 231評(píng)論 0 0

友情鏈接更多精彩內(nèi)容