今天分享的一篇發(fā)表在《Andrology》的文章。文章作者是南方醫(yī)科大學(xué)附屬第三醫(yī)院的泌尿系醫(yī)生，他們主要通過蛋白質(zhì)組學(xué)分析方法從人精漿里發(fā)現(xiàn)了外泌體，有助于日后進(jìn)一步篩選出治療雄性不育和前列腺癌的生物標(biāo)志分子。

IF=2.86，3區(qū)期刊

文章大致思路

簡單介紹一下文章的研究結(jié)果

為了鑒定外泌體的存在，作者首先用western blot鑒定了外泌體標(biāo)記蛋白HSP70和CD81。TEM結(jié)果顯示，精漿外泌體有一層脂質(zhì)雙層膜。這些數(shù)據(jù)可證明外泌體成功地從精漿分離和純化出來。

隨后，作者用LC-MS/MS蛋白質(zhì)組學(xué)分析了精漿外泌體蛋白成分。作者在兩組中鑒定出1474個(gè)蛋白。當(dāng)中有24%是重疊蛋白，包括ALIX、HSP70、ACTB、GAPDH、PHGDH、LGALS3P、SEMG1。然后作者又通過生信方法對非重疊蛋白做富集分析，分析其細(xì)胞成分。結(jié)果發(fā)現(xiàn)。大部分蛋白與外泌體、溶酶體和胞漿有關(guān)，表明這些非重疊蛋白很可能源自于精漿外泌體。然后GO分析了這些外泌體的功能，都跟代謝、細(xì)胞生長與修復(fù)、轉(zhuǎn)運(yùn)有關(guān)。

看了一遍大致上流程是不是覺得自己可以做了呢。概括而言，作者用了LC-MS/MS蛋白質(zhì)組學(xué)分析了精漿蛋白后也就只用了簡單的GO和KEGG方法做了富集分析。分析方法簡單，操作起來也簡單，所以就能輕松發(fā)表在2-3分期刊了。

如果有朋友還對生信工具不太熟悉，跟著我們一起學(xué)習(xí)吧~