蛋白質(zhì)基礎(chǔ)分析

NCBI數(shù)據(jù)庫常用四個(gè)子庫: PubMed、BLAST、Nucleotide、Protein.

對(duì)于一個(gè)蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)分析:

1. 獲得蛋白質(zhì)序列：NCBI

2. 預(yù)測(cè)信號(hào)肽: SignalP 4.1 Server

3.等電點(diǎn)和分子量：Compute PI/Mw(此PI值為根據(jù)一級(jí)序列得來的理論值，并非三級(jí)結(jié)構(gòu)最終的確切值)

4. 預(yù)測(cè)跨膜區(qū): TMHMM

5. 糖基化預(yù)測(cè):

? ? ? N-糖基化預(yù)測(cè): NetNGlyC 1.0 server

6. Protein結(jié)構(gòu)解析出來沒？

BLAST---Protein Blast 進(jìn)行比對(duì)

根據(jù)PDB編號(hào)，在PDB數(shù)據(jù)庫下載PDB格式文件，用Pymol軟件看

7. 預(yù)測(cè)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)的軟件: SWISS-MODEL和Phyre2

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