我們時(shí)常在做生信分析的時(shí)候遇到c或者c++編譯的軟件，這個(gè)時(shí)候我們想安裝他們的話，就得靠我們服務(wù)器上的gnu的gcc或者g++來(lái)編譯進(jìn)行安裝，很多時(shí)候我們沒(méi)有root權(quán)限，這個(gè)時(shí)候應(yīng)該怎么辦呢

1.獲取源代碼：

常用wget/curl下載，也可以用類(lèi)似apt-get source的方式獲取倉(cāng)庫(kù)中軟件源代碼；

2.解壓源代碼安裝包:

tar -zxvf xxx.tar.gz

3.切換到解壓后的目錄,運(yùn)行 ./configure

./configure --help可以列出配置項(xiàng)，
非root用戶最重要的配置項(xiàng)是指定安裝目錄prefix，

 ./configure --prefix=/path/to/bin

在無(wú)法自動(dòng)找到依賴(lài)庫(kù)位置的情況下，用 --with-xx-dir=xxx 的形式配置依賴(lài)庫(kù)位置；

4.進(jìn)行編譯

make &&  make install

這兩條命令可以分開(kāi)執(zhí)行，make時(shí)指定-j參數(shù)并行編譯，能顯著減少編譯耗時(shí)（單進(jìn)程編譯GCC需要幾個(gè)小時(shí)，開(kāi)啟并行編譯后可縮短到十幾分鐘）

5.把安裝好的寫(xiě)入環(huán)境變量

export PATH="/path/to/bin:$PATH"

可將其寫(xiě)到.bashrc或者.bash_profile中；

6.如果編譯過(guò)程遇到缺少庫(kù)的情況

請(qǐng)參照我的這兩篇文章
2023-07-05 | conda包環(huán)境遷移 + 不聯(lián)網(wǎng)服務(wù)器軟件安裝 - 簡(jiǎn)書(shū) (jianshu.com)
2023-07-07 | 一文說(shuō)清楚Linux中的各種PATH - 簡(jiǎn)書(shū) (jianshu.com)

總結(jié)來(lái)源于linux非root用戶安裝軟件入門(mén) - tlanyan (itlanyan.com)
如有侵權(quán)，請(qǐng)聯(lián)系刪除