2018-11-23 群體遺傳學(xué)的知識記錄

什么是測序深度?

Sequence Depth

測序得到的堿基數(shù)總量(我們以bp記錄的)與基因組總的大?。╞p)的比值

我們還要考慮一個測序覆蓋度

Sequence Coverage

覆蓋度是指測序獲得的序列占整個基因組的比例。由于基因組中的高GC、重復(fù)序列等復(fù)雜結(jié)構(gòu)的存在,測序最終拼接組裝獲得的序列往往無法覆蓋有所的區(qū)域,這部分沒有獲得的區(qū)域就稱為Gap。

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