gff3與gtf格式轉(zhuǎn)換

GFF (general feature format): 可以用于任何基因組注釋的存儲(chǔ)

GTF (gene transfer format): 嚴(yán)格的用于基因注釋信息的存儲(chǔ)


格式轉(zhuǎn)換

使用Cufflinks里面的工具"gffread":

使用conda安裝:conda install -c bioconda gffread

#gff3 to gtf

gffread all.gff3 -T -o all.gtf

#gtf to gff3

gffread all.gtf -o- > all.gff3

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